Detail oboru

Bioinformatika a biocomputing

FITZkratka: MBIAk. rok: 2018/2019

Program: Informační technologie

Délka studia: 2 roky

Akreditace od: 1.1.2005Akreditace do: 31.12.2024

Profil

Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se systémy, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.

Klíčové výsledky učení

Student oboru získá hlubší teoretické znalosti a dovednosti v oboru bioinformatiky a počítání podle přírody a získá tak potřebné znalostní a dovednostní základ pro analýzu, návrh a ověřování problémů biologických databází, algoritmů pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky, využití technik počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení.

Profesní profil absolventů s příklady


  • Absolventi mají pokročilé znalosti bioinformatiky, počítání podle přírody (natural computing) a orientují se v principech molekulární genetiky. Dovedou využívat biologické databáze, používat, vytvářet a akcelerovat algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Dokáží aplikovat techniky počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení a tím dosáhnout vylepšení jejich parametrů. 
  • Absolventi mají hluboké teoretické a praktické znalosti v oboru informačních technologií, a to zejména v oblastech pokročilých databázových systémů, teoretické informatiky, hardware/software codesignu a paralelních a distribuovaných algoritmů.
  • Absolventi jsou připraveni pro projektování, provoz a správu bioinformatických počítačových systémů. Jsou schopni aplikovat biologií inspirované metody při návrhu i realizaci výpočetních systémů. Jsou schopni navrhnout a provést experiment, analyzovat a interpretovat data, pracovat samostatně i v týmu, prezentovat výsledky a dále se vzdělávat jak v informatice tak i biologii. 
  • Možné uplatnění je v profesích jako projektant nebo správce bioinformatických počítačových systémů používaných v biotechnologických firmách, zdravotnictví, kriminalistice apod. Absolvent oboru dále uplatní získané vzdělání ve vývojových a výzkumných odděleních firem a institucí zabývajících se vývojem bionformatických systémů nebo výpočetních systémů, které využívají prvky moderní umělé inteligence.

Garant


Struktura předmětů s uvedením ECTS kreditů (studijní plán)

1. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIOBiometrické systémycs, en5PovinnýPZzá,zkP - 39 / L - 6 / PR - 7ano
MATMatematické struktury v informaticecs, en5PovinnýZTzkP - 39 / COZ - 13ano
BCO_MOG1Molekulární genetika Ics3PovinnýPZzkP - 26ano
PDBPokročilé databázové systémycs, en5PovinnýPZzá,zkP - 26 / COZ - 6 / Cp - 6 / PR - 14ano
TINTeoretická informatikacs5PovinnýZTzá,zkP - 39 / PR - 13ano
STISeminář teoretické informatikycs2Volitelný-S - 26ano
1. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIFBioinformatikacs5PovinnýPZzkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
BINBiologií inspirované počítačecs5PovinnýPZzkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
PRLParalelní a distribuované algoritmycs5PovinnýZTzá,zkP - 39 / PR - 13ano
PP1Projektová praxe 1cs, en5Volitelný-PR - 52ano
2. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
PBIPokročilá bioinformatikacs4PovinnýPZzkP - 20 / Cp - 13 / PR - 6ano
SEPSemestrální projektcs, en5PovinnýPZklPR - 65ano
SFCSoft Computingcs5PovinnýPZzá,zkP - 26 / PR - 26ano
THETeorie hercs4PovinnýZTzá,zkP - 26 / PR - 13ano
ZZNZískávání znalostí z databázícs5PovinnýPZzá,zkP - 39 / PR - 13ano
PP2Projektová praxe 2cs5Volitelný-klPR - 52ano
2. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
DIPDiplomová prácecs, en13PovinnýPZPR - 169ano
Libovolný ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
HSCHardware/Software Codesigncs, en5Povinně volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13Hardware a sítěano
PCSPokročilé číslicové systémycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16Hardware a sítěano
JA3Anglická konverzace na aktuální tématacs, en3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26Humanitní předmětano
AEUAngličtina pro Evropucs, en3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26Humanitní předmětano
FCEAngličtina: příprava na zkoušku FCEcs, en3Povinně volitelný-COZ - 26Humanitní předmětano
FITDějiny a filozofie technikycs, en3Povinně volitelný-P - 26Humanitní předmětano
HKOKomunikační dovednostics, en3Povinně volitelný-COZ - 26Humanitní předmětano
HKAKonflikty a asertivitacs3Povinně volitelný-COZ - 26Humanitní předmětano
PRMPrávní minimumcs, en3Povinně volitelný-P - 26Humanitní předmětano
HPRPrezentační dovednostics3Povinně volitelný-COZ - 26Humanitní předmětano
RETRétorikacs, en3Povinně volitelný-P - 26Humanitní předmětano
HVRVedení a řízení lidícs, en3Povinně volitelný-COZ - 26Humanitní předmětano
SINInteligentní systémycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / COZ - 6 / PR - 20Moderní umělá inteligenceano
BISBezpečnost informačních systémůcs5Povinně volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13Operační systémy a bezpečnostano
ZPJaZpracování přirozeného jazyka (v angličtině)en5Povinně volitelný-zkP - 26 / PR - 26Zpracování dat a signálůne
AISAnalýza a návrh informačních systémůcs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
ACHArchitektura procesorůcs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16ano
BMSBezdrátové a mobilní sítěcs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
C3PDiagnostika Cisco sítí (TSHOOT)cs5Volitelný-klL - 52ano
EIPEkonomie informačních produktůcs5Volitelný-zkP - 26 / COZ - 6 / Cp - 12 / PR - 8ano
FAVFormální analýza a verifikacecs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
GZNGrafická a zvuková rozhraní a normycs5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
GJAGrafická uživatelská rozhraní v Javěcs, en5Volitelný-zá,zkP - 26 / PR - 26ano
GUXGrafická uživatelská rozhraní v X Windowcs5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
GMUGrafické a multimediální procesorycs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
GALGrafové algoritmycs, en5Volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
SENInteligentní senzorycs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 4 / L - 4 / PR - 18ano
MMOBModelování biologických systémůcs4Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 13ne
PGRPočítačová grafikacs, en5Volitelný-zkP - 39 / Cp - 6 / PR - 7ano
POVaPočítačové vidění (v angličtině)en5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
PGPaPokročilá počítačová grafika (v angličtině)en5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
PKSPokročilé komunikační systémycs5Volitelný-zá,zkP - 39 / L - 6 / PR - 7ano
PDIProstředí distribuovaných aplikacícs, en5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 6 / PR - 20ano
ROSaReal-time operační systémy (v angličtině)en5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16ano
ROBaRobotika (v angličtině)en5Volitelný-zkP - 26 / L - 6 / PR - 20ano
SMTSeminář matematických strukturcs2Volitelný-S - 26ano
SRIStrategické řízení informačních systémůcs5Volitelný-zkP - 26 / COZ - 2 / Cp - 4 / PR - 20ano
TAMaTvorba aplikací pro mobilní zařízení (v angličtině)en5Volitelný-klP - 26 / PR - 26ano
VYPaVýstavba překladačů (v angličtině)en5Volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
VINVýtvarná informatikacs5Volitelný-klP - 26 / PR - 26ano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelný-PR - 52ano
Libovolný ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
ARCArchitektura a programování paralelních systémůcs5Povinně volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14Hardware a sítěano
NAVNávrh externích adaptérů a vestavěných systémůcs5Povinně volitelný-zkP - 26 / L - 16 / PR - 10Hardware a sítěano
PDSPřenos dat, počítačové sítě a protokolycs, en5Povinně volitelný-zkP - 39 / COZ - 4 / L - 2 / PR - 7Hardware a sítěano
JA3Anglická konverzace na aktuální tématacs, en3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26Humanitní předmětano
AEUAngličtina pro Evropucs, en3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26Humanitní předmětano
FITDějiny a filozofie technikycs, en3Povinně volitelný-P - 26Humanitní předmětne
FIKFilozofie a kulturacs, en3Povinně volitelný-P - 26Humanitní předmětano
HKOKomunikační dovednostics, en3Povinně volitelný-COZ - 26Humanitní předmětano
HKAKonflikty a asertivitacs3Povinně volitelný-COZ - 26Humanitní předmětano
PRMPrávní minimumcs, en3Povinně volitelný-P - 26Humanitní předmětano
HPRPrezentační dovednostics3Povinně volitelný-COZ - 26Humanitní předmětano
RETRétorikacs, en3Povinně volitelný-P - 26Humanitní předmětano
HVRVedení a řízení lidícs, en3Povinně volitelný-COZ - 26Humanitní předmětano
AGSAgentní a multiagentní systémycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13Moderní umělá inteligenceano
EVOAplikované evoluční algoritmycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14Moderní umělá inteligenceano
SNTSimulační nástroje a technikycs5Povinně volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13Moderní umělá inteligenceano
KRYKryptografiecs5Povinně volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13Operační systémy a bezpečnostano
NSBNávrh, správa a bezpečnostcs5Povinně volitelný-zá,zkP - 26 / L - 12 / PR - 6Operační systémy a bezpečnostano
POSPokročilé operační systémycs5Povinně volitelný-zkP - 39 / PR - 13Operační systémy a bezpečnostano
KKOKódování a komprese datcs5Povinně volitelný-zá,zkP - 26 / PR - 26Zpracování dat a signálůano
ZREZpracování řečových signálůcs, en5Povinně volitelný-zkP - 26 / COZ - 2 / Cp - 12 / PR - 12Zpracování dat a signálůano
BZABezpečná zařízenícs5Volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
DFAaDigitální forenzní analýza (v angličtině)en5Volitelný-zkP - 26 / L - 12 / PR - 14ano
DJADynamické jazykycs5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
FLPFunkcionální a logické programovánícs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
FVSFunkční verifikace číslicových systémůcs5Volitelný-zkP - 26 / L - 8 / PR - 18ne
FYOFyzikální optikacs, en5Volitelný-zkP - 26 / COZ - 13 / PR - 13ano
GISGeografické informační systémycs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16ano
WAPInternetové aplikacecs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
LOGLogikacs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 26ano
MPRManagement projektůcs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 4 / Cp - 2 / PR - 20ano
MEKManažerská ekonomikacs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 26ano
HMRMarketingcs5Volitelný-zá,zkP - 26 / C1 - 26ano
MMATMaticový a tenzorový početcs5Volitelný-zá,zkP - 26 / CPP - 18 / O - 8ano
MULMultimédiacs, en5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13ano
OPMOptimalizacecs4Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 13ano
PESPetriho sítěcs5Volitelný-zkP - 39 / Cp - 6 / PR - 7ano
PISPokročilé informační systémycs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
PMAProjektový manažercs5Volitelný-klP - 26 / COZ - 26ano
C2PSítě s vícevrstevným přepínáním (SWITCH)cs5Volitelný-klL - 52ne
SLOaSložitost (v angličtině)en5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
C1PSměrování v rozsáhlých sítích (ROUTE)cs5Volitelný-klL - 52ano
SSPStochastické procesycs4Volitelný-zá,zkP - 26 / CPP - 13ano
FSYSSystémová biologie cs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 26ano
SPPSystémy odolné proti poruchámcs5Volitelný-zá,zkP - 26 / PR - 26ano
UXIaUživatelská zkušenost a návrh rozhraní a služeb (v angličtině)en5Volitelný-klP - 16 / COZ - 10 / PR - 26ano
VIZaVizualizace a CAD (v angličtině)en5Volitelný-klP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
VYFVýpočetní fotografiecs5Volitelný-klP - 26 / PR - 26ano
VGEVýpočetní geometriecs, en5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
VNVVysoce náročné výpočtycs, en5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 26ano
MMZSVyšší metody zpracování signálůcs6Volitelný-zá,zkP - 39 / Cp - 26ano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelný-PR - 52ano
ZPOZpracování obrazucs, en5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
Všechny skupiny volitelných předmětů
Sk. Počet předm. Předměty
Hardware a sítě 1 - 9 HSC, PCS, ARC, NAV, PDS
Humanitní předmět 1 JA3 zimní/letní sem., AEU zimní/letní sem., FCE, FIT zimní/letní sem., HKO zimní/letní sem., HKA zimní/letní sem., PRM zimní/letní sem., HPR zimní/letní sem., RET zimní/letní sem., HVR zimní/letní sem., FIK
Moderní umělá inteligence 1 - 9 SIN, AGS, EVO, SNT
Operační systémy a bezpečnost 1 - 9 BIS, KRY, NSB, POS
Zpracování dat a signálů 1 - 9 ZPJa, KKO, ZRE