Detail oboru

Bioinformatika a biocomputing

FITZkratka: MBIAk. rok: 2022/2023

Program: Informační technologie

Délka studia: 2 roky

Akreditace od: 1.1.2005Akreditace do: 31.12.2024

Profil

Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se systémy, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.

Klíčové výsledky učení

Student oboru získá hlubší teoretické znalosti a dovednosti v oboru bioinformatiky a počítání podle přírody a získá tak potřebné znalostní a dovednostní základ pro analýzu, návrh a ověřování problémů biologických databází, algoritmů pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky, využití technik počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení.

Profesní profil absolventů s příklady


  • Absolventi mají pokročilé znalosti bioinformatiky, počítání podle přírody (natural computing) a orientují se v principech molekulární genetiky. Dovedou využívat biologické databáze, používat, vytvářet a akcelerovat algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Dokáží aplikovat techniky počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení a tím dosáhnout vylepšení jejich parametrů. 
  • Absolventi mají hluboké teoretické a praktické znalosti v oboru informačních technologií, a to zejména v oblastech pokročilých databázových systémů, teoretické informatiky, hardware/software codesignu a paralelních a distribuovaných algoritmů.
  • Absolventi jsou připraveni pro projektování, provoz a správu bioinformatických počítačových systémů. Jsou schopni aplikovat biologií inspirované metody při návrhu i realizaci výpočetních systémů. Jsou schopni navrhnout a provést experiment, analyzovat a interpretovat data, pracovat samostatně i v týmu, prezentovat výsledky a dále se vzdělávat jak v informatice tak i biologii. 
  • Možné uplatnění je v profesích jako projektant nebo správce bioinformatických počítačových systémů používaných v biotechnologických firmách, zdravotnictví, kriminalistice apod. Absolvent oboru dále uplatní získané vzdělání ve vývojových a výzkumných odděleních firem a institucí zabývajících se vývojem bionformatických systémů nebo výpočetních systémů, které využívají prvky moderní umělé inteligence.

Garant


Struktura předmětů s uvedením ECTS kreditů (studijní plán)

1. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIOBiometrické systémycs, en5Povinnýzá,zkP - 39 / L - 6 / PR - 7ano
MATMatematické struktury v informaticecs, en5PovinnýzkP - 39 / COZ - 13ne
BC_MOG1Molekulární genetika Ics3PovinnýzkP - 26ano
PDBPokročilé databázové systémycs, en5Povinnýzá,zkP - 26 / COZ - 6 / Cp - 6 / PR - 14ano
TINTeoretická informatikacs7Povinnýzá,zkP - 39 / S - 10 / COZ - 16 / PR - 13ano
1. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIFBioinformatikacs5PovinnýzkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
BINBiologií inspirované počítačecs5PovinnýzkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
PRLParalelní a distribuované algoritmycs5Povinnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
PP1Projektová praxe 1cs, en5VolitelnýklPR - 52ano
2. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
PBIPokročilá bioinformatikacs4PovinnýzkP - 20 / Cp - 13 / PR - 6ano
SEPSemestrální projektcs, en5PovinnýklPR - 65ano
SFCSoft Computingcs5Povinnýzá,zkP - 26 / PR - 26ano
THETeorie hercs5Povinnýzá,zkP - 26 / PR - 26ano
ZZNZískávání znalostí z databázícs5Povinnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
PP2Projektová praxe 2cs5VolitelnýklPR - 52ano
2. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
DIPDiplomová prácecs, en13PovinnýPR - 169ano
Libovolný ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
HSCHardware/Software Codesigncs, en5Povinně volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13Hardware a sítěano
PCSPokročilé číslicové systémycs5Povinně volitelnýzkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16Hardware a sítěano
JA3Anglická konverzace na aktuální tématacs, en3Povinně volitelnýzá,zkCOZ - 26Humanitní předmětano
FCEAngličtina: praktický kurz obchodní konverzace a prezentacecs, en3Povinně volitelnýCOZ - 26Humanitní předmětano
AEUAngličtina pro Evropucs, en3Povinně volitelnýzá,zkCOZ - 26Humanitní předmětano
FITDějiny a filozofie technikycs2Povinně volitelnýP - 26Humanitní předmětano
FIKFilozofie a kulturacs2Povinně volitelnýCOZ - 26Humanitní předmětano
HKOManažerská komunikace a prezentacecs, en3Povinně volitelnýCOZ - 26Humanitní předmětano
HVRManažerské vedení lidí a řízení časucs, en3Povinně volitelnýCOZ - 26Humanitní předmětano
PRMPrávní minimumcs2Povinně volitelnýP - 26Humanitní předmětano
RETRétorikacs2Povinně volitelnýP - 26Humanitní předmětano
AGSAgentní a multiagentní systémycs5Povinně volitelnýzkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13Moderní umělá inteligenceano
SINInteligentní systémycs5Povinně volitelnýzkP - 26 / PR - 26Moderní umělá inteligenceano
BISBezpečnost informačních systémůcs5Povinně volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13Operační systémy a bezpečnostano
ZPJaZpracování přirozeného jazyka (v angličtině)en5Povinně volitelnýzkP - 26 / PR - 26Zpracování dat a signálůano
AISAnalýza a návrh informačních systémůcs5Volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
AVSArchitektury výpočetních systémůcs5Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
BMSBezdrátové a mobilní sítěcs5Volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
EIPEkonomie informačních produktůcs5VolitelnýzkP - 26 / COZ - 6 / Cp - 12 / PR - 8ne
GZNGrafická a zvuková rozhraní a normycs5VolitelnýzkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
GJAGrafická uživatelská rozhraní v Javěcs, en5Volitelnýzá,zkP - 26 / PR - 26ano
GUXGrafická uživatelská rozhraní v X Windowcs5VolitelnýzkP - 26 / PR - 26ne
GMUGrafické a multimediální procesorycs5Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ne
GALGrafové algoritmycs, en5VolitelnýzkP - 39 / PR - 13ano
PGRPočítačová grafikacs, en5VolitelnýzkP - 39 / Cp - 6 / PR - 7ano
POVaPočítačové vidění (v angličtině)en5VolitelnýzkP - 26 / PR - 26ano
PGPaPokročilá počítačová grafika (v angličtině)en5VolitelnýzkP - 26 / PR - 26ano
PKSaPokročilé komunikační systémy (v angličtině)en5Volitelnýzá,zkP - 39 / L - 6 / PR - 7ano
PDIProstředí distribuovaných aplikacícs, en5VolitelnýzkP - 26 / Cp - 6 / PR - 20ano
ROBaRobotika (v angličtině)en5VolitelnýzkP - 26 / L - 12 / PR - 14ano
SEMSenzory a měřenícs5Volitelnýzá,zkP - 26 / COZ - 6 / L - 6 / PR - 14ano
SAVStatická analýza a verifikacecs5Volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
SRIStrategické řízení informačních systémůcs5VolitelnýzkP - 26 / COZ - 2 / Cp - 4 / PR - 20ano
TAMaTvorba aplikací pro mobilní zařízení (v angličtině)en5VolitelnýklP - 26 / PR - 26ano
VYPaVýstavba překladačů (v angličtině)en5VolitelnýzkP - 39 / PR - 13ano
VINVýtvarná informatikacs5VolitelnýklP - 26 / PR - 26ano
ZPXZahraniční odborná praxeen5VolitelnýPR - 52ano
Libovolný ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
NAVNávrh vestavěných systémůcs5Povinně volitelnýzkP - 26 / L - 16 / PR - 10Hardware a sítěano
PPPPraktické paralelní programovánícs5Povinně volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 16 / PR - 10Hardware a sítěano
PDSPřenos dat, počítačové sítě a protokolycs, en5Povinně volitelnýzkP - 39 / COZ - 4 / L - 2 / PR - 26Hardware a sítěano
JA3Anglická konverzace na aktuální tématacs, en3Povinně volitelnýzá,zkCOZ - 26Humanitní předmětano
AEUAngličtina pro Evropucs, en3Povinně volitelnýzá,zkCOZ - 26Humanitní předmětano
FITDějiny a filozofie technikycs2Povinně volitelnýP - 26Humanitní předmětano
FIKFilozofie a kulturacs2Povinně volitelnýCOZ - 26Humanitní předmětano
HKOManažerská komunikace a prezentacecs, en3Povinně volitelnýCOZ - 26Humanitní předmětano
HVRManažerské vedení lidí a řízení časucs, en3Povinně volitelnýCOZ - 26Humanitní předmětano
PRMPrávní minimumcs2Povinně volitelnýP - 26Humanitní předmětano
RETRétorikacs2Povinně volitelnýP - 26Humanitní předmětano
EVOAplikované evoluční algoritmycs5Povinně volitelnýzkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14Moderní umělá inteligenceano
SNTSimulační nástroje a technikycs5Povinně volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13Moderní umělá inteligenceano
KRYKryptografiecs5Povinně volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13Operační systémy a bezpečnostano
NSBNávrh, správa a bezpečnostcs5Povinně volitelnýzá,zkP - 26 / L - 12 / PR - 6Operační systémy a bezpečnostano
POSPokročilé operační systémycs5Povinně volitelnýzkP - 39 / PR - 13Operační systémy a bezpečnostano
KKOKódování a komprese datcs5Povinně volitelnýzá,zkP - 26 / PR - 26Zpracování dat a signálůano
ZREZpracování řečových signálůcs, en5Povinně volitelnýzkP - 26 / COZ - 2 / Cp - 12 / PR - 12Zpracování dat a signálůano
MBAAnalýza systémů založená na modelechcs5VolitelnýzkP - 39 / Cp - 6 / PR - 7ano
BZABezpečná zařízenícs5VolitelnýzkP - 39 / PR - 13ano
CSOaCCNA Kybernetická bezpečnost (v angličtině)en5VolitelnýklP - 26 / L - 26ano
DFAaDigitální forenzní analýza (v angličtině)en5VolitelnýzkP - 26 / L - 13 / PR - 13ano
DJADynamické jazykycs5VolitelnýzkP - 26 / PR - 26ne
FLPFunkcionální a logické programovánícs5Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
FVSFunkční verifikace číslicových systémůcs5VolitelnýzkP - 26 / L - 8 / PR - 18ne
FYOFyzikální optikacs, en5VolitelnýzkP - 26 / COZ - 13 / PR - 13ano
GISGeografické informační systémycs5Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16ne
WAPInternetové aplikacecs5Volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
LOGLogikacs5Volitelnýzá,zkP - 26 / COZ - 26ano
MPRManagement projektůcs5Volitelnýzá,zkP - 26 / COZ - 4 / Cp - 2 / PR - 20ano
MPC-MATMaticový a tenzorový početcs5Volitelnýzá,zkP - 26 / CPP - 18 / PR - 8ano
MULMultimédiacs, en5VolitelnýzkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13ano
OPMOptimalizacecs4Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 13ano
PISPokročilé informační systémycs5Volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
PMAProjektový manažercs5VolitelnýklP - 26 / COZ - 26ano
SLOaSložitost (v angličtině)en5VolitelnýzkP - 26 / PR - 26ano
MPA-SYSSystems Biologyen5Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 26ano
SPPSystémy odolné proti poruchámcs5Volitelnýzá,zkP - 26 / PR - 26ano
RTSaSystémy pracující v reálném čase (v angličtině)en5VolitelnýzkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16ano
UXIaUživatelská zkušenost a návrh rozhraní a služeb (v angličtině)en5VolitelnýklP - 16 / COZ - 10 / PR - 26ano
VIZaVizualizace a CAD (v angličtině)en5VolitelnýklP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
VYFVýpočetní fotografiecs5VolitelnýklP - 26 / PR - 26ano
VGEVýpočetní geometriecs, en5VolitelnýzkP - 26 / PR - 26ano
VNVVysoce náročné výpočtycs, en5VolitelnýzkP - 26 / Cp - 26ano
ZPXZahraniční odborná praxeen5VolitelnýPR - 52ano
ZPOZpracování obrazucs, en5VolitelnýzkP - 26 / PR - 26ano
Všechny skupiny volitelných předmětů
Sk. Počet kreditů Počet předm. Předměty
Hardware a sítě nekontroluje se 1 - 9 HSC, PCS, NAV, PPP, PDS
Humanitní předmět 3 kr 1 JA3 (3 kr) zimní/letní sem., FCE (3 kr), AEU (3 kr) zimní/letní sem., FIT (2 kr) zimní/letní sem., FIK (2 kr) zimní/letní sem., HKO (3 kr) zimní/letní sem., HVR (3 kr) zimní/letní sem., PRM (2 kr) zimní/letní sem., RET (2 kr) zimní/letní sem.
Moderní umělá inteligence nekontroluje se 1 - 9 AGS, SIN, EVO, SNT
Operační systémy a bezpečnost nekontroluje se 1 - 9 BIS, KRY, NSB, POS
Zpracování dat a signálů nekontroluje se 1 - 9 ZPJa, KKO, ZRE