Detail oboru

Bioinformatika a biocomputing

FITZkratka: MBIAk. rok: 2010/2011

Program: Informační technologie

Délka studia:

Profil

Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se obvody, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.

Klíčové výsledky učení


  • Absolventi mají pokročilé znalosti bioinformatiky, počítání podle přírody (natural computing) a orientují se v principech molekulární genetiky. Dovedou využívat biologické databáze, používat, vytvářet a akcelerovat algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Dokáží aplikovat techniky počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení a tím dosáhnout vylepšení jejich parametrů. 
  • Absolventi mají hluboké teoretické a praktické znalosti v oboru informačních technologií, a to zejména v oblastech pokročilých databázových systémů, teoretické informatiky, hardware/software codesignu a paralelních a distribuovaných algoritmů.
  • Absolventi jsou připraveni pro projektování, provoz a správu bioinformatických počítačových systémů. Jsou schopni aplikovat biologií inspirované metody při návrhu i realizaci výpočetních systémů. Jsou schopni navrhnout a provést experiment, analyzovat a interpretovat data, pracovat samostatně i v týmu, prezentovat výsledky a dále se vzdělávat jak v informatice tak i biologii. 
  • Možné uplatnění je v profesích jako projektant nebo správce bioinformatických počítačových systémů používaných v biotechnologických firmách, zdravotnictví, kriminalistice apod. Absolvent oboru dále uplatní získané vzdělání ve vývojových a výzkumných odděleních firem a institucí zabývajících se vývojem bionformatických systémů nebo výpočetních systémů, které využívají prvky moderní umělé inteligence.

Garant


Struktura předmětů s uvedením ECTS kreditů (studijní plán)

1. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIOBiometrické systémycs, en5Povinný-zá,zkP - 39 / L - 6 / PR - 7ano
HSCHardware/Software Codesigncs, en5Povinný-zkP - 39 / PR - 13ano
MATMatematické struktury v informaticecs, en5Povinný-zkP - 39 / COZ - 13ano
MOGMolekulární genetikacs3Povinný-zkP - 26ano
PDBPokročilé databázové systémycs, en5Povinný-zá,zkP - 26 / COZ - 6 / Cp - 6 / PR - 14ano
TINTeoretická informatikacs5Povinný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
BISBezpečnost informačních systémůcs5Povinně volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
SINInteligentní systémycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / COZ - 10 / Cp - 2 / PR - 14ano
STISeminář teoretické informatikycs2Volitelný-COZ - 26ano
1. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIFBioinformatikacs5Povinný-zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
BINBiologií inspirované počítačecs5Povinný-zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
PRLParalelní a distribuované algoritmycs5Povinný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
AGSAgentní a multiagentní systémycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13ano
EVOAplikované evoluční algoritmycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
KKOKódování a komprese datcs5Povinně volitelný-zá,zkP - 26 / PR - 26ano
KRYKryptografiecs5Povinně volitelný-zá,zkP - 26 / PR - 13ano
NSBNávrh, správa a bezpečnostcs5Povinně volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 26ano
POSPokročilé operační systémycs5Povinně volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
SNTSimulační nástroje a technikycs5Povinně volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
ZREZpracování řečových signálůcs, en5Povinně volitelný-zkP - 26 / COZ - 2 / Cp - 12 / PR - 12ano
2. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
PBIPokročilá bioinformatikacs4Povinný-zkP - 20 / Cp - 13 / PR - 6ano
SEPSemestrální projektcs, en3Povinný-klPR - 39ano
SFCSoft Computingcs5Povinný-zkP - 26 / PR - 26ano
THETeorie hercs4Povinný-zá,zkP - 26 / PR - 13ano
ZZNZískávání znalostí z databázícs5Povinný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
PCSPokročilé číslicové systémycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16ano
2. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
DIPDiplomový projektcs, en10Povinný-PR - 156ano
ARCArchitektura a programování paralelních systémůcs5Povinně volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
NAVNávrh externích adaptérů a vestavěných systémůcs5Povinně volitelný-zkP - 26 / Cp - 10 / L - 16ano
PDSPřenos dat, počítačové sítě a protokolycs, en5Povinně volitelný-zkP - 39 / COZ - 4 / L - 2 / PR - 7ano
Libovolný ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
AJEAkademické jazykové dovednosti se zaměřením na elektroinženýrství a informatikucs3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26ano
AEUAngličtina pro Evropucs, en3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26ano
ASAAngličtina pro Severní Amerikucs3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26ano
FITDějiny a filozofie technikycs, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
AECEfektivní čtení odborných anglických textůcs3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26ano
PRMPrávní minimumcs, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
RETRétorikacs, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
AISAnalýza a návrh informačních systémůcs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
ACHArchitektura procesorůcs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
BMSBezdrátové a mobilní sítěcs5Volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
EIPEkonomie informačních produktůcs5Volitelný-zkP - 26 / COZ - 6 / PR - 20ano
FAVFormální analýza a verifikacecs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
GZNGrafická a zvuková rozhraní a normycs5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
GUXGrafická uživatelská rozhraní v X Windowcs5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
GMUGrafické a multimediální procesorycs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
GALGrafové algoritmycs, en5Volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
SENInteligentní senzorycs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 4 / L - 4 / PR - 18ano
KRGKreativní grafikacs4Volitelný-klP - 13 / PR - 26ano
OPMOptimalizacecs4Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 13ano
PGRPočítačová grafikacs, en5Volitelný-zkP - 39 / Cp - 6 / PR - 7ano
POVPočítačové viděnícs5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
PGPPokročilá počítačová grafikacs5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
PKSPokročilé komunikační systémycs5Volitelný-zá,zkP - 39 / L - 8 / PR - 5ano
PDIProstředí distribuovaných aplikacícs, en5Volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
ROSReal-time operační systémycs5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16ano
ROBRobotikacs5Volitelný-zkP - 26 / L - 6 / PR - 20ano
SRIStrategické řízení informačních systémůcs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 4 / Cp - 4 / PR - 18ano
SRESystémy zpracování řečics5Volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
TAMTvorba aplikací pro mobilní zařízenícs5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
CP2Zabezpečení sítí WAN (CCNP2)cs4Volitelný-klL - 52ano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelný-ano
Libovolný ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
AJEAkademické jazykové dovednosti se zaměřením na elektroinženýrství a informatikucs3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26ano
AEUAngličtina pro Evropucs, en3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26ano
ASAAngličtina pro Severní Amerikucs3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26ano
AECEfektivní čtení odborných anglických textůcs3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26ano
FIKFilozofie a kulturacs, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
PRMPrávní minimumcs, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
RETRétorikacs, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
DJADynamické jazykycs5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 6 / PR - 20ano
FLPFunkcionální a logické programovánícs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
FSYFuzzy systémy pro řízení a modelovánícs5Volitelný-zá,zkP - 26 / PR - 26ano
FYOFyzikální optikacs, en5Volitelný-zkP - 26 / COZ - 13 / PR - 13ano
GISGeografické informační systémycs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 4 / PR - 9ano
GJAGrafická uživatelská rozhraní v Javěcs, en5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
WAPInternetové aplikacecs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
LOGLogikacs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 26ano
MPRManagement projektůcs5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 6 / PR - 20ano
MEKManažerská ekonomikacs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 26ano
MARMarketingcs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 26ano
MOBModelování biologických systémůcs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 7ano
MULMultimédiacs, en5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13ano
CP4Optimalizované a konvergentní sítě (CCNP4)cs4Volitelný-klL - 52ano
PESPetriho sítěcs5Volitelný-zkP - 39 / Cp - 6 / PR - 7ano
PISPokročilé informační systémycs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
SLOSložitostcs5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
SSPStochastické procesycs4Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 13ano
STMStrategický managementcs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 13 / PR - 13ano
SPPSystémy odolné proti poruchámcs5Volitelný-zá,zkP - 26 / PR - 26ano
VIZVizualizace a CADcs5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13ano
VNVVysoce náročné výpočtycs, en5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 26ano
VINVýtvarná informatikacs5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelný-ano
ZPOZpracování obrazucs, en5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano