Detail předmětu

Úvod do medicínské informatiky

FEKT-BUMIAk. rok: 2010/2011

Počítače v medicíně a biologii. Data v medicíně. Počítačový pacientský záznam. IZIP - internetový přístup ke zdravotním informacím pacienta. Podpora lékařské diagnostiky. Fuzzy logika a expertní systémy. Biomedicínská statistika. Standardy v medicínské informatice. Úvod do bioinformatiky. Zpracování genetické informace. Úvod do proteomiky. Zpracování a identifikace proteinů. Úloha bioinformatiky v proteomice.

Jazyk výuky

čeština

Počet kreditů

5

Výsledky učení předmětu

Základní znalosti a praxe v medicínské informatice se zaměřením na zpracování medicínských dat.

Prerekvizity

Jsou požadovány znalosti na úrovni středoškolského studia.

Plánované vzdělávací činnosti a výukové metody

Metody vyučování závisejí na způsobu výuky a jsou popsány článkem 7 Studijního a zkušebního řádu VUT.

Způsob a kritéria hodnocení

Dva projekty, průběžný test, závěrečný písemný test. Pro získání zápočtu je nutné odevzdat oba projekty, získat alespoň celkem 50% bodů z projektů a průběžného testu (v součtu). Pro složení zkoušky je nutné získat alespoň 50% bodů ze závěrečného písemného testu.

Učební cíle

Poskytnout základní teoretické znalosti a praktické zkušenosti z oblasti medicínské informatiky. Znalosti pokrývají oblast zpracování specifických medicínských dat, základy návrhu medicínských informačních systémů a počítačově podporovanou medicínskou diagnostiku.

Vymezení kontrolované výuky a způsob jejího provádění a formy nahrazování zameškané výuky

Vymezení kontrolované výuky a způsob jejího provádění stanoví každoročně aktualizovaná vyhláška garanta předmětu.

Zařazení předmětu ve studijních plánech

  • Program EEKR-B bakalářský

    obor B-EST , 3. ročník, zimní semestr, volitelný mimooborový
    obor B-MET , 3. ročník, zimní semestr, volitelný mimooborový

  • Program EEKR-CZV celoživotní vzdělávání (není studentem)

    obor ET-CZV , 1. ročník, zimní semestr, volitelný mimooborový

Typ (způsob) výuky

 

Přednáška

26 hod., nepovinná

Vyučující / Lektor

Osnova

Počítače v medicíně a biologii. Zpracování informace v biomedicínském výzkumu a klinické praxi, vztah medicínské informatiky ke klinické praxi, biomedicínskému inženýrství, molekulární biologii, rozhodování, informačním vědám a počítačovým vědám.
Data v medicíně. Medicínská data, použití, nevýhody tradičních pacientských záznamů, úloha počítačů v archivaci, získávání a interpretaci dat, databáze a znalostní báze, sběr dat a generování hypotéz, prevalence, prediktivní hodnota, sensitivita a specificita, vstup dat do medicínské databáze.
Počítačový pacientský záznam. Definice počítačového pacientského záznamu (CPR), rozdíl CPR od tradičního záznamu, funkční komponenty CPR, výhody CPR, vývoj a použití CPR.
IZIP - internetový přístup ke zdravotním informacím pacienta.
Podpora lékařské diagnostiky.
Fuzzy logika a expertní systémy.
Biomedicínská statistika.
Standardy v medicínské informatice. Význam standardů v medicínské informatice, standardizační organizace, standardy v managementu medicínských informací, proces vytváření konsenzuálního standardu, faktory tvorby standardů.
Úvod do bioinformatiky.
Zpracování genetické informace.
Uvod do proteomiky - proteiny, jejich stavba, proteom, DNA kodovani proteinu, pojem proteomika, vzajemna interakce proteinu, zdroje, web tutorialy, literatura.
Zpracovani a identifikace proteinu - zpusoby, hmotnostni spektrometrie (tandem MS/MS), zarizeni pro hmotnostni spektrometrii, priprava vzorku a separacni metody (LC, gely), tryptic digest, vznik spektra
Uloha bioinformatiky v proteomice - proteomicke FASTA databaze, interpretace hmotnostniho spektra, search engines (XTandem, Mascot, Sequest, De Novo), prakticka ukazka indentifikace a reprezentace vysledku.

Cvičení na počítači

26 hod., nepovinná

Vyučující / Lektor

Osnova

Reprezentace biosignálů a medicínských obrazů
Potlačení specifických typů rušení v biologických signálech
Základní druhy zpracování medicínských obrazů
Biostatistické metody v medicíně
Použití diagnostických expertních systémů
Základní modely v biologii a epidemiologii
Úvod do použití medicínského informačního systému MIS CLINICOM
Emulace terminálu a moduly MIS CLINICOM
Vstup textových dat do MIS CLINICOM
Reprezentace dat v MIS CLINICOM
Administrace a přístupová práva v MIS CLINICOM
Výstupní sestavy MIS CLINICOM
Řešení zadaného projektu