Publikace

• 2023

  NYKRÝNOVÁ, M.; JUREČKOVÁ, K.; MUSILOVÁ, J.; SLANINOVÁ, E.; OBRUČA, S.; HANSLIKOVA, J.; FLEURIOT-BLITMAN, H.; ZINN, M.; SEDLÁŘ, K. Genomic and phenotypic analysis of Rhodospirillum rubrum – wild type and mutant strain. 10th International Chemical-Technological Conference (ICCT), Mikulov, Czechia. 2023.
  Detail

  MUSILOVÁ, J.; VAFEK, Z.; HEŘMÁNKOVÁ, K.; KOUŘILOVÁ, X.; PERNICOVÁ, I.; OBRUČA, S.; PUNYIA, B.; HELIKAR, T.; SEDLÁŘ, K. Introducing Augusta, a Python package for inferring Gene Regulatory and Boolean Networks from RNA-Seq data, and its application to the Caldimonas thermodepolymerans DSM 15344T. 2023.
  Detail | WWW

  MUSILOVÁ, J.; KOUŘILOVÁ, X.; HEŘMÁNKOVÁ, K.; BEZDÍČEK, M.; OBRUČA, S.; SEDLÁŘ, K. Comparative genomic analysis of two Schlegelella species brings novel insights into polyhydroxyalkanoates production. 10th International Chemical-Technological Conference (ICCT), Mikulov, Czechia. 2023.
  Detail

  PERNICOVÁ, I.; KOUŘILOVÁ, X.; ŘEHÁKOVÁ, V.; DYAGILEV, D.; MARKOVÁ, L.; SEDLÁŘ, K.; MUSILOVÁ, J.; SEDLÁČEK, P.; OBRUČA, S. Rod Aneurinibacillus – unikátní bakterie mezi termofilními producenty polyhydroxyalkanoátů. Book of abstracts of the 10th International Conference on Chemical Technology. 1. Praha: AMCA, spol. s.r.o., 2023. s. 19-19. ISBN: 978-80-88214-40-3.
  Detail | WWW

  ŠVEC, P.; BUSSE, H.; SEDLÁŘ, K.; MUSILOVÁ, J.; KRÁLOVÁ, S.; STAŇKOVÁ, E.; ŠEDO, O.; KRSEK, D.; KOUBLOVÁ, V.; KRIŠTOFOVÁ, L.; SEDLÁČEK, I. Corynebacterium antarcticum sp. nov., Corynebacterium marambiense sp. nov., Corynebacterium meridianum sp. nov., and Corynebacterium pygosceleis sp. nov., isolated from Adelie penguins (Pygoscelis adeliae). SYSTEMATIC AND APPLIED MICROBIOLOGY, 2023, roč. 46, č. 1, ISSN: 0723-2020.
  Detail | WWW

  KOUŘILOVÁ, X.; PERNICOVÁ, I.; MUSILOVÁ, J.; SEDLÁŘ, K.; OBRUČA, S. Využitelnost termofilních bakterií jako producentů biopolymerů. Book of abstracts of the 10th International Conference on Chemical Technology. 1. Praha: AMCA, spol. s.r.o., 2023. s. 20-20. ISBN: 978-80-88214-40-3.
  Detail | WWW

  NYKRÝNOVÁ, M.; JUREČKOVÁ, K.; MUSILOVÁ, J.; SLANINOVÁ, E.; OBRUČA, S.; FLEURIOT-BLITMAN, H.; ZINN, M.; SEDLÁŘ, K. Transcriptome Analysis of Rhodospirillum rubrum - Wild Type and Mutant Strains. 11th European Symposium on Biopolymer (ESBP). 2023.
  Detail

• 2022

  MUSILOVÁ, J.; KOUŘILOVÁ, X.; BEZDÍČEK, M.; OBRUČA, S.; SEDLÁŘ, K. Comparison of short and long reads in structural and functional annotation of non-model bacteria. 2022. s. 11-11.
  Detail | WWW

  MUSILOVÁ, J.; KOUŘILOVÁ, X.; PERNICOVÁ, I.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; OBRUČA, S.; SEDLÁŘ, K. Novel thermophilic polyhydroxyalkanoates producing strain Aneurinibacillus thermoaerophilus CCM 8960. Applied Microbiology and Biotechnology, 2022, roč. 106, č. 12, s. 1-13. ISSN: 1432-0614.
  Detail | WWW

  KOUŘILOVÁ, X.; PERNICOVÁ, I.; MUSILOVÁ, J.; SEDLÁŘ, K.; OBRUČA, S. Some (Bacteria) Like It Hot - Towards Sustianable Produciton of Bioplastics Employing Thermophilic Bacteria. The Biomania Student Scientific Meeting 2022, Book of abstract. 1st. Brno: Masaryk University Press, 2022. s. 123-123. ISBN: 978-80-280-0040-0.
  Detail

  SEDLÁŘ, K.; MUSILOVÁ, J.; KOUŘILOVÁ, X.; BEZDÍČEK, M.; OBRUČA, S. Diversity of Schlegelella thermodepolymerans Revealed with Nanopore Sequencing. In Proceedings of the 9th International Conference on Chemical Technology. Prague: Czech Society of Industrial Chemistry, 2022. s. 373-378. ISBN: 978-80-88307-11-2.
  Detail

  SEDLÁŘ, K.; MUSILOVÁ, J.; ŠKUTKOVÁ, H.; NYKRÝNOVÁ, M.; JUREČKOVÁ, K.; PERNICOVÁ, I.; SLANINOVÁ, E.; FLEURIOT-BLITMAN, H.; ZINN, M.; OBRUČA, S. Improving structural annotation of Rhodospirillum rubrum DSM 467 with RNA-Seq. 18th International Symposium on Biopolymers (ISBP). 2022.
  Detail

  KOUŘILOVÁ, X.; PERNICOVÁ, I.; MUSILOVÁ, J.; VIDLÁKOVÁ, M.; SEDLÁŘ, K.; OBRUČA, S. K udržitelné produkci biopolymerů pomocí termofilních mikroorganismů. 2022.
  Detail | WWW

  PERNICOVÁ, I.; KOUŘILOVÁ, X.; ŘEHÁKOVÁ, V.; MUSILOVÁ, J.; SEDLÁŘ, K.; OBRUČA, S. “Hot” producers of polyhydroxyalkanoates as the future of the biotechnological industry. 2022.
  Detail | WWW

• 2021

  MUSILOVÁ, J.; KOUŘILOVÁ, X.; OBRUČA, S.; SEDLÁŘ, K.; LENGEROVÁ, M.; BEZDÍČEK, M. Potential functional capacity of a non-model organism Aneurinibacillus species H1. 2021.
  Detail

  KOUŘILOVÁ, X.; PERNICOVÁ, I.; MUSILOVÁ, J.; SEDLÁŘ, K.; OBRUČA, S. Screening cultivation mode and production of the new bacterium Aneurinibacillus thermoaerophilus CCM 8960. The Eurobiotech Journal. Sciendo, 2021. s. 98-98.
  Detail | WWW

  MUSILOVÁ, J.; KOUŘILOVÁ, X.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; OBRUČA, S.; ŠKUTKOVÁ, H.; SEDLÁŘ, K. First Complete Genome of the Thermophilic Polyhydroxyalkanoates Producing Bacterium Schlegelella thermodepolymerans DSM 15344. GENOME BIOL EVOL, 2021, roč. 13, č. 4, s. 1-13. ISSN: 1759-6653.
  Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

  SCHWARZEROVÁ, J.; MUSILOVÁ, J.; JUREČKOVÁ, K.; BRANSKÁ, B.; PROVAZNÍK, I.; PATÁKOVÁ, P.; SEDLÁŘ, K. Operon Structure Inference in Clostridium beijerinckii NRRL B-589 using RNA-Seq. In 8th International Conference on Chemical Technology. 2021. s. 284-289. ISBN: 978-80-88307-08-2.
  Detail

  PATÁKOVÁ, P.; BRANSKÁ, B.; VASYLKIVSKA, M.; JUREČKOVÁ, K.; MUSILOVÁ, J.; PROVAZNÍK, I.; SEDLÁŘ, K. Transcriptomic studies of solventogenic clostridia, Clostridium acetobutylicum and Clostridium beijerinckii. BIOTECHNOLOGY ADVANCES, 2021, roč. 58, č. 1, s. 1-18. ISSN: 1873-1899.
  Detail | WWW

  MUSILOVÁ, J.; SEDLÁŘ, K. Tools for Time-Course Simulation in Systems Biology: A Brief Overview. Briefings in Bioinformatics, 2021, roč. 22, č. 5, s. 1-15. ISSN: 1477-4054.
  Detail | WWW

  MUSILOVÁ, J. PATHWAYS IDENTIFICATION IN THE GRAM-POSITIVE BACTERIUM ANEURINIBACILLUS SPECIES H1. In Proceedings II of the 27th Conference STUDENT EEICT 2021 selected papers. 1. Brno: Brno University of Technology, Faculty of Electrical Engineering and Communication, 2021. s. 111-115. ISBN: 978-80-214-5943-4.
  Detail | WWW

• 2020

  KOUŘILOVÁ, X.; PERNICOVÁ, I.; SEDLÁŘ, K.; MUSILOVÁ, J.; SEDLÁČEK, P.; KALINA, M.; KOLLER, M.; OBRUČA, S. Production of polyhydroxyalkanoates (PHA) by a thermophilic strain of Schlegelella thermodepolymerans from xylose rich substrates. BIORESOURCE TECHNOLOGY, 2020, roč. 315, č. 8, s. 1-7. ISSN: 0960-8524.
  Detail | WWW

  KOUŘILOVÁ, X.; MUSILOVÁ, J.; SEDLÁŘ, K.; BEDNÁROVÁ, K.; PERNICOVÁ, I.; OBRUČA, S. Thermophilic Bacterium Schlegelella thermodepolymerans DSM 15344 as a Producer of Polyhydroxyalkanoates. Studentská odborná konference CHEMIE JE ŽIVOT 2020. Brno: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta chemická, 2020. s. 90-91. ISBN: 978-80-214-5920-0.
  Detail

  MUSILOVÁ, J. HOMOLOGSEARCH: R Package for Identyfying Homologous Sequences between Model and Non-model Organisms. In Proceeding I of the 26th Conference STUDENT EEICT 2020. Brno: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, 2020. s. 334-338. ISBN: 978-80-214-5867-3.
  Detail | WWW

  SEDLÁŘ, K.; VASYLKIVSKA, M.; MUSILOVÁ, J.; BRANSKÁ, B.; PROVAZNÍK, I.; PATÁKOVÁ, P. Phenotypic and genomic analysis of isopropanol and 1,3-propanediol producer Clostridium diolis DSM 15410. GENOMICS, 2020, roč. 113, č. 1, s. 1109-1119. ISSN: 0888-7543.
  Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

• 2019

  MUSILOVÁ, J.; JUREČKOVÁ, K.; KOLEK, J.; PROVAZNÍK, I.; PATÁKOVÁ, P.; SEDLÁŘ, K. Signaling Pathway for Butanol Production in Clostridium beijerinckii NRRL B-598. In Proceedings of the 7th International Conference on Chemical Technology. Czech Society of Industrial Chemistry, 2019. s. 46-52. ISBN: 978-80-88307-00-6.
  Detail | WWW

  MUSILOVÁ, J. Signaling Pathway for Butanol Production in Clostridium beijerinckii NRRL B-598. In Proceedings of the 25th Conference STUDENT EEICT 2019. Brno: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, 2019. s. 187-190. ISBN: 978-80-214-5735-5.
  Detail | WWW

  PATÁKOVÁ, P.; VASYLKIVSKA, M.; JUREČKOVÁ, K.; MUSILOVÁ, J.; KOLEK, J.; BRANSKÁ, B.; SEDLÁŘ, K. Stress response to butyric acid and butanol formation in Clostridium beijerinckii at transcriptional level. 14th International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms - Abstracts. 2019. s. 209-209.
  Detail

• 2018

  MUSILOVÁ, J.; KOŠČOVÁ, P. Network Analysis of Proteins Associated with Schizophrenia. In Proceedings of the 24rd Conference STUDENT EEICT 2018. Brno: 2018. s. 273-275. ISBN: 978-80-214-5614-3.
  Detail

• 2017

  MUSILOVÁ, J.; KOŠČOVÁ, P. Interakce léčiv užívaných při léčbě schizofrenie. In Proceedings of the 23rd Conference STUDENT EEICT 2017. Brno: 2017. s. 18-20. ISBN: 978-80-214-5496-5.
  Detail

*) Citace publikací se generují jednou za 24 hodin.