prof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D.

1. Evoluce a význam hub proteinů v mapování interaktomu a jejich úloha v oblasti výzkumu multi-cílených léků

   Cílem disertační práce je konstrukce a analýza interakční sítě protein-protein nazývané hub. Analýza těchto sítí spojených s nemocí nabízí nové metody pro objevování léků. Cílový protein je uvažován v souvislostech, včetně jeho propojení s jinými proteiny, což může být klíčové pro nalezení robustnějších léčiv. U některých onemocnění je identifikace více síťových cílů nezbytná. Například rakovina není výsledkem jednoho mutovaného genu; podstupuje evoluční "boj o přežití" proti obraně hostitelského organismu. U některých lidských nádorů byly popsány mutace ve více než 100 genech.

   Školitel: Provazník Valentýna, prof. Ing., Ph.D.

2. Identifikace selektivních inhibitorů na bázi přírodních molekul interagujících s virovými infekcemi

   Cílem disertační práce je propojit bioinformatické metodologie pro identifikaci selektivních inhibitorů na bázi přírodních molekul interagujících s virovými infekcemi. Bude proveden virtuální screening databází přírodních molekul proti sadě receptorů týkajících se vybraného virového onemocnění. Screening bude následován ADMET profilací pro studium farmakokinetických a farmakodynamických vlastností zkoumaných sloučenin. Následné 3D QSAR mapování farmakoforu umožní vhodně sloučeniny popsat a bude sloužit pro přípravu modelu trénovací databáze. Molekuly začleněné do screeningu budou začleněny do testovací databáze. Identifikovaná sloučenina bude sloužit jako inhibitor vybraného onemocnění. Návrh virtuálních analogů a jejich vhodná syntéza pak potenciálně zlepší účinnost sloučenin.

   Školitel: Provazník Valentýna, prof. Ing., Ph.D.