Detail oboru

Bioinformatika a biocomputing

FITZkratka: MBIAk. rok: 2017/2018

Program: Informační technologie

Délka studia: 2 roky

Akreditace od: 30.6.2014Akreditace do: 31.12.2022

Profil

Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se systémy, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.

Klíčové výsledky učení

Student oboru získá hlubší teoretické znalosti a dovednosti v oboru bioinformatiky a počítání podle přírody a získá tak potřebné znalostní a dovednostní základ pro analýzu, návrh a ověřování problémů biologických databází, algoritmů pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky, využití technik počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení.

Profesní profil absolventů s příklady


  • Absolventi mají pokročilé znalosti bioinformatiky, počítání podle přírody (natural computing) a orientují se v principech molekulární genetiky. Dovedou využívat biologické databáze, používat, vytvářet a akcelerovat algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Dokáží aplikovat techniky počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení a tím dosáhnout vylepšení jejich parametrů. 
  • Absolventi mají hluboké teoretické a praktické znalosti v oboru informačních technologií, a to zejména v oblastech pokročilých databázových systémů, teoretické informatiky, hardware/software codesignu a paralelních a distribuovaných algoritmů.
  • Absolventi jsou připraveni pro projektování, provoz a správu bioinformatických počítačových systémů. Jsou schopni aplikovat biologií inspirované metody při návrhu i realizaci výpočetních systémů. Jsou schopni navrhnout a provést experiment, analyzovat a interpretovat data, pracovat samostatně i v týmu, prezentovat výsledky a dále se vzdělávat jak v informatice tak i biologii. 
  • Možné uplatnění je v profesích jako projektant nebo správce bioinformatických počítačových systémů používaných v biotechnologických firmách, zdravotnictví, kriminalistice apod. Absolvent oboru dále uplatní získané vzdělání ve vývojových a výzkumných odděleních firem a institucí zabývajících se vývojem bionformatických systémů nebo výpočetních systémů, které využívají prvky moderní umělé inteligence.

Garant


Struktura předmětů s uvedením ECTS kreditů (studijní plán)

1. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIOBiometrické systémycs, en5Povinný-zá,zkP - 39 / L - 6 / PR - 7ano
MATMatematické struktury v informaticecs, en5Povinný-zkP - 39 / COZ - 13ano
PDBPokročilé databázové systémycs, en5Povinný-zá,zkP - 26 / COZ - 6 / Cp - 6 / PR - 14ano
TINTeoretická informatikacs5Povinný-zá,zkano
STISeminář teoretické informatikycs2Volitelný-ano
1. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIFBioinformatikacs5Povinný-zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
BINBiologií inspirované počítačecs5Povinný-zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
PRLParalelní a distribuované algoritmycs5Povinný-zá,zkano
2. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
PBIPokročilá bioinformatikacs4Povinný-zkP - 20 / Cp - 13 / PR - 6ano
SEPSemestrální projektcs, en5Povinný-klano
SFCSoft Computingcs5Povinný-zá,zkano
THETeorie hercs4Povinný-zá,zkano
ZZNZískávání znalostí z databázícs5Povinný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
2. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
DIPDiplomová prácecs, en13Povinný-PR - 169ano
Libovolný ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
AEUAngličtina pro Evropucs, en3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26ano
FCEAngličtina: příprava na zkoušku FCEcs, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
BISBezpečnost informačních systémůcs5Povinně volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
FITDějiny a filozofie technikycs, en3Povinně volitelný-P - 26ano
HSCHardware/Software Codesigncs, en5Povinně volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
SINInteligentní systémycs5Povinně volitelný-zkano
HKOKomunikační dovednostics, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
HKAKonflikty a asertivitacs3Povinně volitelný-COZ - 26ano
PCSPokročilé číslicové systémycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16ano
PRMPrávní minimumcs, en3Povinně volitelný-ano
HPRPrezentační dovednostics3Povinně volitelný-COZ - 26ano
HPOPsychologie osobnostics3Povinně volitelný-COZ - 26ano
RETRétorikacs, en3Povinně volitelný-ano
HVRVedení a řízení lidícs, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
ZPJaZpracování přirozeného jazyka (v angličtině)en5Povinně volitelný-zkne
AISAnalýza a návrh informačních systémůcs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
ACHArchitektura procesorůcs5Volitelný-zá,zkP - 39 / Cp - 10 / PR - 13ano
BMSBezdrátové a mobilní sítěcs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
EIPEkonomie informačních produktůcs5Volitelný-zkP - 26 / COZ - 6 / Cp - 12 / PR - 8ano
FAVFormální analýza a verifikacecs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
GZNGrafická a zvuková rozhraní a normycs5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
GJAGrafická uživatelská rozhraní v Javěcs, en5Volitelný-zá,zkP - 26 / PR - 26ano
GUXGrafická uživatelská rozhraní v X Windowcs5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
GMUGrafické a multimediální procesorycs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
GALGrafové algoritmycs, en5Volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
SENInteligentní senzorycs5Volitelný-zá,zkano
PGRPočítačová grafikacs, en5Volitelný-zkP - 39 / Cp - 6 / PR - 7ano
POVaPočítačové vidění (v angličtině)en5Volitelný-zkano
PGPaPokročilá počítačová grafika (v angličtině)en5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
PKSPokročilé komunikační systémycs5Volitelný-zá,zkP - 39 / L - 6 / PR - 7ano
PDIProstředí distribuovaných aplikacícs, en5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 6 / PR - 20ano
ROBaRobotika (v angličtině)en5Volitelný-zkano
SMTSeminář matematických strukturcs2Volitelný-ano
SRIStrategické řízení informačních systémůcs5Volitelný-zkano
TAMaTvorba aplikací pro mobilní zařízení (v angličtině)en5Volitelný-klano
VYPaVýstavba překladačů (v angličtině)en5Volitelný-zkano
VINVýtvarná informatikacs5Volitelný-klano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelný-ano
Libovolný ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
AGSAgentní a multiagentní systémycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13ano
EVOAplikované evoluční algoritmycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
ARCArchitektura a programování paralelních systémůcs5Povinně volitelný-zá,zkP - 39 / Cp - 12 / PR - 13ano
FIKFilozofie a kulturacs, en3Povinně volitelný-P - 26ano
KKOKódování a komprese datcs5Povinně volitelný-zá,zkP - 26 / PR - 26ano
HKOKomunikační dovednostics, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
HKAKonflikty a asertivitacs3Povinně volitelný-COZ - 26ano
KRYKryptografiecs5Povinně volitelný-zá,zkP - 26 / PR - 13ano
NAVNávrh externích adaptérů a vestavěných systémůcs5Povinně volitelný-zkP - 26 / L - 16 / PR - 10ano
NSBNávrh, správa a bezpečnostcs5Povinně volitelný-zá,zkP - 26 / L - 12 / PR - 6ano
POSPokročilé operační systémycs5Povinně volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
PRMPrávní minimumcs, en3Povinně volitelný-ano
HPRPrezentační dovednostics3Povinně volitelný-COZ - 26ano
PDSPřenos dat, počítačové sítě a protokolycs, en5Povinně volitelný-zkP - 39 / COZ - 4 / L - 2 / PR - 7ano
HPOPsychologie osobnostics3Povinně volitelný-COZ - 26ano
RETRétorikacs, en3Povinně volitelný-ano
SNTSimulační nástroje a technikycs5Povinně volitelný-zá,zkano
HVRVedení a řízení lidícs, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
ZREZpracování řečových signálůcs, en5Povinně volitelný-zkano
DJADynamické jazykycs5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 6 / PR - 20ano
FLPFunkcionální a logické programovánícs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
FVSFunkční verifikace číslicových systémůcs5Volitelný-zkP - 26 / L - 8 / PR - 18ano
FYOFyzikální optikacs, en5Volitelný-zkP - 26 / COZ - 13 / PR - 13ano
WAPInternetové aplikacecs5Volitelný-zá,zkano
LOGLogikacs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 26ano
MPRManagement projektůcs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 4 / Cp - 2 / PR - 20ano
MEKManažerská ekonomikacs5Volitelný-zá,zkP - 26 / COZ - 26ano
MMATMaticový a tenzorový početcs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 18 / O - 8ano
MULMultimédiacs, en5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13ano
OPMOptimalizacecs4Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 13ano
PESPetriho sítěcs5Volitelný-zkP - 39 / Cp - 6 / PR - 7ano
PISPokročilé informační systémycs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
PMAProjektový manažercs5Volitelný-klP - 26 / COZ - 26ano
ROSaReal-time operační systémy (v angličtině)en5Volitelný-zkano
SLOaSložitost (v angličtině)en5Volitelný-zkano
SSPStochastické procesycs4Volitelný-zá,zkP - 26 / CPP - 13ano
STMStrategický managementcs5Volitelný-zá,zkano
SPPSystémy odolné proti poruchámcs5Volitelný-zá,zkano
VIZaVizualizace a CAD (v angličtině)en5Volitelný-klano
VYFVýpočetní fotografiecs5Volitelný-klano
VGEVýpočetní geometriecs, en5Volitelný-zkano
VNVVysoce náročné výpočtycs, en5Volitelný-zkano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelný-ano
ZPOZpracování obrazucs, en5Volitelný-zkano