Detail oboru

Bioinformatika a biocomputing

FITZkratka: MBIAk. rok: 2017/2018

Program: Informační technologie

Délka studia: 2 roky

Akreditace od: 30.6.2014Akreditace do: 31.12.2022

Profil

Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se systémy, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.

Klíčové výsledky učení

Student oboru získá hlubší teoretické znalosti a dovednosti v oboru bioinformatiky a počítání podle přírody a získá tak potřebné znalostní a dovednostní základ pro analýzu, návrh a ověřování problémů biologických databází, algoritmů pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky, využití technik počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení.

Profesní profil absolventů s příklady


  • Absolventi mají pokročilé znalosti bioinformatiky, počítání podle přírody (natural computing) a orientují se v principech molekulární genetiky. Dovedou využívat biologické databáze, používat, vytvářet a akcelerovat algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Dokáží aplikovat techniky počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení a tím dosáhnout vylepšení jejich parametrů. 
  • Absolventi mají hluboké teoretické a praktické znalosti v oboru informačních technologií, a to zejména v oblastech pokročilých databázových systémů, teoretické informatiky, hardware/software codesignu a paralelních a distribuovaných algoritmů.
  • Absolventi jsou připraveni pro projektování, provoz a správu bioinformatických počítačových systémů. Jsou schopni aplikovat biologií inspirované metody při návrhu i realizaci výpočetních systémů. Jsou schopni navrhnout a provést experiment, analyzovat a interpretovat data, pracovat samostatně i v týmu, prezentovat výsledky a dále se vzdělávat jak v informatice tak i biologii. 
  • Možné uplatnění je v profesích jako projektant nebo správce bioinformatických počítačových systémů používaných v biotechnologických firmách, zdravotnictví, kriminalistice apod. Absolvent oboru dále uplatní získané vzdělání ve vývojových a výzkumných odděleních firem a institucí zabývajících se vývojem bionformatických systémů nebo výpočetních systémů, které využívají prvky moderní umělé inteligence.

Garant


Struktura předmětů s uvedením ECTS kreditů (studijní plán)

1. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIOBiometrické systémycs5Povinnýzá,zkP - 39 / L - 6 / PR - 7ano
MATMatematické struktury v informaticecs, en5PovinnýzkP - 39 / COZ - 13ano
MOGMolekulární genetikacs3PovinnýzkP - 26ano
PDBPokročilé databázové systémycs, en5Povinnýzá,zkP - 26 / COZ - 6 / Cp - 6 / PR - 14ano
TINTeoretická informatikacs5Povinnýzá,zkano
STISeminář teoretické informatikycs2Volitelnýano
1. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIFBioinformatikacs5PovinnýzkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
BINBiologií inspirované počítačecs5PovinnýzkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
PRLParalelní a distribuované algoritmycs5Povinnýzá,zkano
2. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
PBIPokročilá bioinformatikacs4PovinnýzkP - 20 / Cp - 13 / PR - 6ano
SEPSemestrální projektcs, en5Povinnýklano
SFCSoft Computingcs5Povinnýzá,zkano
THETeorie hercs4Povinnýzá,zkano
ZZNZískávání znalostí z databázícs5Povinnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
2. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
DIPDiplomová prácecs, en13PovinnýPR - 169ano
Libovolný ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
AEUAngličtina pro Evropucs3Povinně volitelnýzá,zkCOZ - 26ano
FCEAngličtina: příprava na zkoušku FCEcs, en3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
BISBezpečnost informačních systémůcs5Povinně volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
FITDějiny a filozofie technikycs, en3Povinně volitelnýP - 26ano
HSCHardware/Software Codesigncs, en5Povinně volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
SINInteligentní systémycs5Povinně volitelnýzkano
HKOKomunikační dovednostics3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
HKAKonflikty a asertivitacs3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
PCSPokročilé číslicové systémycs5Povinně volitelnýzkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16ano
PRMPrávní minimumcs, en3Povinně volitelnýano
HPRPrezentační dovednostics3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
HPOPsychologie osobnostics3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
RETRétorikacs, en3Povinně volitelnýano
HVRVedení a řízení lidícs3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
ZPJaZpracování přirozeného jazyka (v angličtině)en5Povinně volitelnýzkano
AISAnalýza a návrh informačních systémůcs5Volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
ACHArchitektura procesorůcs5Volitelnýzá,zkP - 39 / Cp - 10 / PR - 13ano
BMSBezdrátové a mobilní sítěcs5Volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
EIPEkonomie informačních produktůcs5VolitelnýzkP - 26 / COZ - 6 / Cp - 12 / PR - 8ano
FAVFormální analýza a verifikacecs5Volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
GZNGrafická a zvuková rozhraní a normycs5VolitelnýzkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
GJAGrafická uživatelská rozhraní v Javěcs, en5Volitelnýzá,zkP - 26 / PR - 26ano
GUXGrafická uživatelská rozhraní v X Windowcs5VolitelnýzkP - 26 / PR - 26ano
GMUGrafické a multimediální procesorycs5Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
GALGrafové algoritmycs, en5VolitelnýzkP - 39 / PR - 13ano
SENInteligentní senzorycs5Volitelnýzá,zkano
MOBModelování biologických systémůcs4Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 13ano
PGRPočítačová grafikacs, en5VolitelnýzkP - 39 / Cp - 6 / PR - 7ano
POVaPočítačové vidění (v angličtině)en5Volitelnýzkano
PGPaPokročilá počítačová grafika (v angličtině)en5VolitelnýzkP - 26 / PR - 26ano
PKSPokročilé komunikační systémycs5Volitelnýzá,zkP - 39 / L - 6 / PR - 7ano
PDIProstředí distribuovaných aplikacícs, en5VolitelnýzkP - 26 / Cp - 6 / PR - 20ano
ROBaRobotika (v angličtině)en5Volitelnýzkano
SMTSeminář matematických strukturcs2Volitelnýano
SRIStrategické řízení informačních systémůcs5Volitelnýzkano
TAMaTvorba aplikací pro mobilní zařízení (v angličtině)en5Volitelnýklano
VYPaVýstavba překladačů (v angličtině)en5Volitelnýzkano
VINVýtvarná informatikacs5Volitelnýklano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelnýano
Libovolný ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
AGSAgentní a multiagentní systémycs5Povinně volitelnýzkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13ano
EVOAplikované evoluční algoritmycs5Povinně volitelnýzkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
ARCArchitektura a programování paralelních systémůcs5Povinně volitelnýzá,zkP - 39 / Cp - 12 / PR - 13ano
FIKFilozofie a kulturacs, en3Povinně volitelnýP - 26ano
KKOKódování a komprese datcs5Povinně volitelnýzá,zkP - 26 / PR - 26ano
HKOKomunikační dovednostics, en3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
HKAKonflikty a asertivitacs3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
KRYKryptografiecs5Povinně volitelnýzá,zkP - 26 / PR - 13ano
NAVNávrh externích adaptérů a vestavěných systémůcs5Povinně volitelnýzkP - 26 / L - 16 / PR - 10ano
NSBNávrh, správa a bezpečnostcs5Povinně volitelnýzá,zkP - 26 / L - 12 / PR - 6ano
POSPokročilé operační systémycs5Povinně volitelnýzkP - 39 / PR - 13ano
PRMPrávní minimumcs, en3Povinně volitelnýano
HPRPrezentační dovednostics3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
PDSPřenos dat, počítačové sítě a protokolycs, en5Povinně volitelnýzkP - 39 / COZ - 4 / L - 2 / PR - 7ano
HPOPsychologie osobnostics3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
RETRétorikacs, en3Povinně volitelnýano
SNTSimulační nástroje a technikycs5Povinně volitelnýzá,zkano
HVRVedení a řízení lidícs, en3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
ZREZpracování řečových signálůcs, en5Povinně volitelnýzkano
DJADynamické jazykycs5VolitelnýzkP - 26 / Cp - 6 / PR - 20ano
FLPFunkcionální a logické programovánícs5Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
FVSFunkční verifikace číslicových systémůcs5VolitelnýzkP - 26 / L - 8 / PR - 18ano
FYOFyzikální optikacs, en5VolitelnýzkP - 26 / COZ - 13 / PR - 13ano
WAPInternetové aplikacecs5Volitelnýzá,zkano
LOGLogikacs5Volitelnýzá,zkP - 26 / COZ - 26ano
MPRManagement projektůcs5Volitelnýzá,zkP - 26 / COZ - 4 / Cp - 2 / PR - 20ano
MEKManažerská ekonomikacs5Volitelnýzá,zkP - 26 / COZ - 26ano
MARMarketingcs5Volitelnýzá,zkP - 26 / COZ - 26ano
MMATMaticový a tenzorový početcs5Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 18 / O - 8ano
MULMultimédiacs, en5VolitelnýzkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13ano
OPMOptimalizacecs4Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 13ano
PESPetriho sítěcs5VolitelnýzkP - 39 / Cp - 6 / PR - 7ano
PISPokročilé informační systémycs5Volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
PMAProjektový manažercs5VolitelnýklP - 26 / COZ - 26ano
ROSaReal-time operační systémy (v angličtině)en5Volitelnýzkano
SLOaSložitost (v angličtině)en5Volitelnýzkano
SSPStochastické procesycs (en)4Volitelnýzá,zkP - 26 / CPP - 13ano
STMStrategický managementcs5Volitelnýzá,zkano
SYSSystémová biologiecs5Volitelnýzá,zkano
SPPSystémy odolné proti poruchámcs5Volitelnýzá,zkano
VIZaVizualizace a CAD (v angličtině)en5Volitelnýklano
VYFVýpočetní fotografiecs5Volitelnýklano
VGEVýpočetní geometriecs, en5Volitelnýzkano
VNVVysoce náročné výpočtycs, en5Volitelnýzkano
MZSVyšší metody zpracování signálůcs6Volitelnýzá,zkP - 39 / Cp - 26ano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelnýano
ZPOZpracování obrazucs, en5Volitelnýzkano