Detail aplikovaného výsledku

Optofluidní mikročip s teplotním gradientem pro určování teplotní stability biomolekul v segmentovaném toku

FOHLEROVÁ, Z.; PODEŠVA, P.; NEUŽIL, P.

Originální název

Optofluidní mikročip s teplotním gradientem pro určování teplotní stability biomolekul v segmentovaném toku

Anglický název

Characterization of Biomolecules’ Thermal Stability in Segmented Flow-Through Optofluidic Microsystem

Druh

Funkční vzorek

Abstrakt

Byl vyroben křemíkový čip s trubkovitými mikrokanály utopenými uvnitř substrátu s teplotním gradientem (∇T) podél mikrokanálu. Sestavili jsme optický fluorescenční systém skládající se z modulovaného laserového světelného zdroje 470 nm připojeného optickými vlákny k mikrokanálu, který sloužil jako světlovod. Fluorescence byla detekována na druhé straně mikrokanálu pomocí fotonásobiče připojeného k optickému vláknu přes fluorescein isothiokyanátový filtr. Výstup z PMT byl napojen na lock-in zesilovač. Provedli jsme analýzu křivky tání krátké sekvence dsDNA - SYBR Green I o známé teplotě tání v průtokové konfiguraci bez gradientu, abychom ověřili funkčnost navrhovaného detekčního systému. Potom jsme použili konfiguraci segmentovaného toku a změřili amplitudu fluorescence kapičky vystavené ∇T of 2,31 ° C mm-1. Navrhovaná platforma může být použita jako rychlý a nákladově efektivní systém pro provádění buď MCA dsDNA nebo pro měření rozložení proteinu pro aplikace screeningu léků.

Abstrakt aglicky

We developed a silicon chip with tubular microchannels buried inside the substrate featuring temperature gradient (∇T) along the microchannel. We set up an optical fluorescence system consisting of a power-modulated laser light source of 470 nm coupled to the microchannel serving as a light guidevia optical fiber. Fluorescence was detected on the other side of the microchannel using a photomultiplier tube connected to an optical fiber via a fluorescein isothiocyanate filter. The PMT output was connected to a lock-in amplifier for signal processing. We performed a melting curve analysis of a short dsDNA – SYBR Green I complex with a known melting temperature (TM) in a flow-through configuration without gradient to verify the functionality of proposed detection system. We then used the segmented flow configuration and measured the fluorescence amplitude of a droplet exposed to ∇T of ≈ 2.31°C mm-1. The proposed platform can be used as a fast and cost-effective system for performing either MCA of dsDNAs or for measuring protein unfolding for drug-screening applications.

Klíčová slova

Optofluidics, temperature gradient, melting temperature of dsDNA, protein unfolding

Klíčová slova anglicky

Optofluidics, temperature gradient, melting temperature of dsDNA, protein unfolding

Umístění

Ústav mikroelektroniky Vysoké učení technické v Brně

Licenční poplatek

K využití výsledku jiným subjektem je vždy nutné nabytí licence

Dokumenty