Detail oboru

Bioinformatika a biocomputing

FITZkratka: MBIAk. rok: 2014/2015

Program: Informační technologie

Délka studia: 2 roky

Profil

Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se systémy, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.

Klíčové výsledky učení

Student oboru získá hlubší teoretické znalosti a dovednosti v oboru bioinformatiky a počítání podle přírody a získá tak potřebné znalostní a dovednostní základ pro analýzu, návrh a ověřování problémů biologických databází, algoritmů pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky, využití technik počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení.

Profesní profil absolventů s příklady


  • Absolventi mají pokročilé znalosti bioinformatiky, počítání podle přírody (natural computing) a orientují se v principech molekulární genetiky. Dovedou využívat biologické databáze, používat, vytvářet a akcelerovat algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Dokáží aplikovat techniky počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení a tím dosáhnout vylepšení jejich parametrů. 
  • Absolventi mají hluboké teoretické a praktické znalosti v oboru informačních technologií, a to zejména v oblastech pokročilých databázových systémů, teoretické informatiky, hardware/software codesignu a paralelních a distribuovaných algoritmů.
  • Absolventi jsou připraveni pro projektování, provoz a správu bioinformatických počítačových systémů. Jsou schopni aplikovat biologií inspirované metody při návrhu i realizaci výpočetních systémů. Jsou schopni navrhnout a provést experiment, analyzovat a interpretovat data, pracovat samostatně i v týmu, prezentovat výsledky a dále se vzdělávat jak v informatice tak i biologii. 
  • Možné uplatnění je v profesích jako projektant nebo správce bioinformatických počítačových systémů používaných v biotechnologických firmách, zdravotnictví, kriminalistice apod. Absolvent oboru dále uplatní získané vzdělání ve vývojových a výzkumných odděleních firem a institucí zabývajících se vývojem bionformatických systémů nebo výpočetních systémů, které využívají prvky moderní umělé inteligence.

Garant


Struktura předmětů s uvedením ECTS kreditů (studijní plán)

1. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIOBiometrické systémycs, en5Povinný-zá,zkP - 39 / L - 6 / PR - 7ano
MATMatematické struktury v informaticecs, en5Povinný-zkano
MOGMolekulární genetikacs3Povinný-zkano
PDBPokročilé databázové systémycs, en5Povinný-zá,zkano
TINTeoretická informatikacs5Povinný-zá,zkano
STISeminář teoretické informatikycs2Volitelný-ano
1. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIFBioinformatikacs5Povinný-zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
BINBiologií inspirované počítačecs5Povinný-zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
PRLParalelní a distribuované algoritmycs5Povinný-zá,zkano
2. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
PBIPokročilá bioinformatikacs4Povinný-zkano
SEPSemestrální projektcs, en5Povinný-klano
SFCSoft Computingcs5Povinný-zá,zkano
THETeorie hercs4Povinný-zá,zkano
ZZNZískávání znalostí z databázícs5Povinný-zá,zkano
2. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
DIPDiplomový projektcs, en13Povinný-PR - 169ano
Libovolný ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
AEUAngličtina pro Evropucs3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26ano
FCEAngličtina: příprava na zkoušku FCEcs3Povinně volitelný-ano
BISBezpečnost informačních systémůcs5Povinně volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
FITDějiny a filozofie technikycs3Povinně volitelný-ano
HSCHardware/Software Codesigncs, en5Povinně volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
SINInteligentní systémycs5Povinně volitelný-zkano
HKAKonflikty a asertivitacs3Povinně volitelný-COZ - 26ano
PCSPokročilé číslicové systémycs5Povinně volitelný-zkano
PRMPrávní minimumcs, en3Povinně volitelný-ano
HPOPsychologie osobnostics3Povinně volitelný-COZ - 26ano
HVRVedení a řízení lidícs, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
AISAnalýza a návrh informačních systémůcs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
ACHArchitektura procesorůcs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 26ano
BMSBezdrátové a mobilní sítěcs5Volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
EIPEkonomie informačních produktůcs5Volitelný-zkP - 26 / COZ - 6 / PR - 20ano
FAVFormální analýza a verifikacecs5Volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 13ano
GZNGrafická a zvuková rozhraní a normycs5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
GUXGrafická uživatelská rozhraní v X Windowcs5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
GMUGrafické a multimediální procesorycs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
GALGrafové algoritmycs, en5Volitelný-zkP - 39 / PR - 13ano
SENInteligentní senzorycs5Volitelný-zá,zkano
KRGKreativní grafikacs4Volitelný-klano
MOBModelování biologických systémůcs4Volitelný-zá,zkano
OPMOptimalizacecs4Volitelný-zá,zkano
PGRPočítačová grafikacs, en5Volitelný-zkano
POVPočítačové viděnícs5Volitelný-zkano
PGPPokročilá počítačová grafikacs5Volitelný-zkano
PKSPokročilé komunikační systémycs5Volitelný-zá,zkano
PDIProstředí distribuovaných aplikacícs, en5Volitelný-zkano
ROSReal-time operační systémycs5Volitelný-zkano
ROBRobotikacs5Volitelný-zkano
SSPStochastické procesycs4Volitelný-zá,zkano
SRIStrategické řízení informačních systémůcs5Volitelný-zkano
TAMTvorba aplikací pro mobilní zařízenícs5Volitelný-zkano
VYPeVýstavba překladačů (v angličtině)en5Volitelný-zkano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelný-ano
Libovolný ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Prof.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
AGSAgentní a multiagentní systémycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13ano
AEUAngličtina pro Evropucs, en3Povinně volitelný-zá,zkCOZ - 26ano
EVOAplikované evoluční algoritmycs5Povinně volitelný-zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
ARCArchitektura a programování paralelních systémůcs5Povinně volitelný-zá,zkP - 39 / PR - 26ano
FIKFilozofie a kulturacs, en3Povinně volitelný-ano
KKOKódování a komprese datcs5Povinně volitelný-zá,zkano
HKOKomunikační dovednostics, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
HKAKonflikty a asertivitacs3Povinně volitelný-COZ - 26ano
KRYKryptografiecs5Povinně volitelný-zá,zkano
NAVNávrh externích adaptérů a vestavěných systémůcs5Povinně volitelný-zkano
NSBNávrh, správa a bezpečnostcs5Povinně volitelný-zá,zkano
POSPokročilé operační systémycs5Povinně volitelný-zkano
HPRPrezentační dovednostics3Povinně volitelný-COZ - 26ano
PDSPřenos dat, počítačové sítě a protokolycs, en5Povinně volitelný-zkano
HPOPsychologie osobnostics3Povinně volitelný-COZ - 26ano
RETRétorikacs, en3Povinně volitelný-ano
SNTSimulační nástroje a technikycs5Povinně volitelný-zá,zkano
HVRVedení a řízení lidícs, en3Povinně volitelný-COZ - 26ano
ZREZpracování řečových signálůcs, en5Povinně volitelný-zkano
DJADynamické jazykycs5Volitelný-zkP - 26 / Cp - 6 / PR - 20ano
FLPFunkcionální a logické programovánícs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
FYOFyzikální optikacs, en5Volitelný-zkP - 26 / COZ - 13 / PR - 13ano
GISGeografické informační systémycs5Volitelný-zá,zkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16ano
GJAGrafická uživatelská rozhraní v Javěcs, en5Volitelný-zkP - 26 / PR - 26ano
WAPInternetové aplikacecs5Volitelný-zá,zkano
LOGLogikacs5Volitelný-zá,zkano
MPRManagement projektůcs5Volitelný-zá,zkano
MEKManažerská ekonomikacs5Volitelný-zá,zkano
MARMarketingcs5Volitelný-zá,zkano
MULMultimédiacs, en5Volitelný-zkano
PESPetriho sítěcs5Volitelný-zkano
PISPokročilé informační systémycs5Volitelný-zá,zkano
MZSPokročilé zpracování signálůcs6Volitelný-zá,zkano
PMAProjektový manažercs5Volitelný-klano
C2PSítě s vícevrstevným přepínáním (SWITCH)cs5Volitelný-klL - 52ano
SLOSložitostcs5Volitelný-zkano
SVSeSpecifikace vestavěných systémů (v angličtině)en5Volitelný-zkano
STMStrategický managementcs5Volitelný-zá,zkano
SPPSystémy odolné proti poruchámcs5Volitelný-zá,zkano
VIZVizualizace a CADcs5Volitelný-klano
VGEVýpočetní geometriecs, en5Volitelný-zkano
VNVVysoce náročné výpočtycs, en5Volitelný-zkano
VINVýtvarná informatikacs5Volitelný-zkano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelný-ano
ZPOZpracování obrazucs, en5Volitelný-zkano