Analyzátor pro tvorbu a vyhodnocení fylogenetické stromové struktury

Analyzer for reconstruction and evaluation of phylogenetic tree structure

Software

Software pro rekonstrukci fylogenetických stromů získaných pomocí různých známých metod s nastavením vstupních parametrů fylogenetické analýzy jako jsou: skórovací matice, výpočet vzájemné distance, rekonstrukční algoritmus, cena mezer apod. U získané stromové struktury dále program umožňuje srovnání metod a analýzu biologických sekvencí pomocí bootstrappingových technik a klastrování s nastavitelnými vstupními kritérii.

Software for reconstruction and analysis of phylogenetic tree using several different methods with setting of input parameters as: scoring matrixes, distance matrix methods, algorithm for reconstruction, penalties for opening gaps etc.

phylogenetic tree, biologic sequences, bootstrapping, tree clusterring, fasta

phylogenetic tree, biologic sequences, bootstrapping, tree clusterring, fasta

Ústav biomedicínského inženýrství, FEKT VUT v Brně, Kolejní 4 61200 Brno

výsledek využívá pouze poskytovatel

Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)

http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty