Rostoucí rezistence vůči dosud známým antibiotikům posouvá výzkum zabývající se hledáním nových a účinných antimikrobiálních látek do dosud neprobádaných a extrémních prostředí, jako jenapříklad Antarktida. Mikrobiální ribosomálně syntetizované a posttranslačně modifikované peptidy (RiPPs) ukazují potenciál jako významný zdroj antimikrobiálních přírodních látek. Tento projekt zkoumá potenciál antarktických bakterií produkovat RiPPs se slibnou bioaktivitou. Předpokládáme, že extrémní prostředí Antarktidy umožňuje identifikaci adaptačně specifických RiPP klastrů a následní analýza jejich produktů odhalí funkční klastry kódující nové, dosud nepopsané bioaktivní molekuly. Náš projekt využívá pokročilé metody k identifikaci ekologicky specifických RiPPs v antarktických bakteriích, optimalizaci jejich exprese a charakterizaci jejich bioaktivního potenciálu. Hlavním cílem tohoto projektu je pochopit adaptaci a regulaci biosyntézy RiPPs u extrémofilních bakterií a zefektivnit objevování divergentních a terapeuticky hodnotných přírodních peptidů.

Klíčová slova
sekundární metabolity;přírodní látky;ribozomálně-syntetizované přírodní látky;bioaktivní metabolity;biosyntetické genové klastry;ekologická specificita;půdní bakterie;Antarktida;

25-17343S

čeština

Vítková Helena, Ing., Ph.D. - spoluřešitel

Ústav biomedicínského inženýrství
- odpovědné pracoviště (25.3.2024 - nezadáno)
Ústav biomedicínského inženýrství
- příjemce (25.3.2024 - nezadáno)

VÍTKOVÁ, H.; JAKUBÍČKOVÁ, M.; BEZDÍČEK KRÁLOVÁ, S. Consensus-Based Detection of Biosynthetic Gene Clusters with Application to RiPPs from Antartic Bacteria. ENBIK 2025, Karlov pod Pradědem. 2025.
Detail

Odpovědnost: Petrovičová Gabriela, Ing.