Dvouletý magisterský studijní program Řízení a ekonomika podniku je organizován formou prezenčního studia. Studium je zaměřeno na ekonomiku a řízení podniku jako celku i jeho jednotlivých funkcí, s důrazem na řízení výroby. Studium je zakončeno státní závěrečnou zkouškou, jejíž součástí je obhajoba diplomové práce a rozprava ze širšího základu oboru. Úspěšným absolventům je udělen titul „inženýr“ (Ing.).