Project detail

Pokročilé metody analýzy biologických systémů, signálů a obrazů

Duration: 1.1.2010 — 31.12.2010

Funding resources

Vysoké učení technické v Brně - Vnitřní projekty VUT

On the project

Projekt se zabývá výzkumem a vývojem metod pro zpracování a analýzu biologických signálů a obrazů, které produkují živé systémy na různých úrovních složitosti (od DNA přes buňky, srdeční sval až po lidské tělo) nebo diagnostické, zejména zobrazovací systémy. Dále je také zaměřen na simulaci a analýzu fyzikálních polí, používaných v lékařské diagnostice a terapii.

Mark

FEKT-S-10-15

Default language

Czech

People responsible

Kolář Radim, doc. Ing., Ph.D. - principal person responsible
Bartoš Michal, Ing., Ph.D. - fellow researcher
Čech Petr, Ing. - fellow researcher
Čmiel Vratislav, Ing., Ph.D. - fellow researcher
Gazárek Jiří, Ing. - fellow researcher
Harabiš Vratislav, Ing., Ph.D. - fellow researcher
Havlíček Martin, Ing., Ph.D. - fellow researcher
Hrozek Jan, Ing. - fellow researcher
Jan Jiří, prof. Ing., CSc. - fellow researcher
Janoušek Oto, Ing., Ph.D. - fellow researcher
Jiřík Radovan, doc. Ing., Ph.D. - fellow researcher
Kolářová Jana, doc. Ing., Ph.D. - fellow researcher
Kozumplík Jiří, doc. Ing., CSc. - fellow researcher
Maděránková Denisa, Ing., Ph.D. - fellow researcher
Malínský Miloš, Ing., Ph.D. - fellow researcher
Odstrčilík Jan, Ing., Ph.D. - fellow researcher
Peter Roman, Ing., Ph.D. - fellow researcher
Provazník Valentýna, prof. Ing., Ph.D. - fellow researcher
Rozman Jiří, doc. Ing., CSc. - fellow researcher
Smital Lukáš, Ing., Ph.D. - fellow researcher
Taševský Pavel, Ing. - fellow researcher
Valla Martin, Ing. - fellow researcher

Units

Department of Biomedical Engineering
- responsible department (1.1.1989 - not assigned)
Department of Biomedical Engineering
- internal (1.1.2010 - 31.12.2010)
Faculty of Electrical Engineering and Communication
- beneficiary (1.1.2010 - 31.12.2010)

Results

GAZÁREK, J.; JAN, J.; KOLÁŘ, R.; ODSTRČILÍK, J.: xx; Software pro detekci fokálního výpadku vrstvy nervových vláken pomocí texturní analýzy. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

DRASTICH, A.; NOVOTNÝ, L.; KOLÁŘ, R.: xx; Kvantitativní hodnocení kvality CT RTG zobrazení. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/. (Software)
Detail

ČECH, P.; ČÍŽEK, M.; DLOUHÝ, J.; ROZMAN, J.: xx; Systém monitorování polohy hlavy. xx. (Prototyp)
Detail

ODSTRČILÍK, J.; KOLÁŘ, R.; HARABIŠ, V.; JAN, J.; GAZÁREK, J.; NOVOTNÝ, A.: xx; Software pro detekci výpadku ve vrstvě nervových vláken na sítnici. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

KUBICOVÁ, V.; VALLA, M.; PROVAZNÍK, I.: xx; Program pro vyhodnocení výsledku Brdičkovy reakce. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

GAZÁREK, J.; KOLÁŘ, R.; JAN, J.; ODSTRČILÍK, J.: xx; Software pro rekonstrukci cévního řečiště z dat optické koherentní tomografie. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

RONZHINA, M.; JANOUŠEK, O.; KOLÁŘOVÁ, J.; PROVAZNÍK, I.: xx; Software pro analýzu spánkového EEG. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

VÍTEK, M.; KOZUMPLÍK, J.: xx; Software pro rozměření signálů EKG. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

DRASTICH, A.; FIALA, P.; KOLÁŘ, R.: xx; Modelování procesu projekčního a projekčně-rekonstrukčního RTG zobrazení. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/. (Software)
Detail

ODSTRČILÍK, J.; SVOBODA, O.; BUDAI, A.; KOLÁŘ, R.; JAN, J.; GAZÁREK, J.: xx; Gold standard database for evaluation of fundus image segmentation algorithms. xx. URL: http://www5.informatik.uni-erlangen.de/research/data/fundus-images; http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

ČECH, P.; ČÍŽEK, M.; DLOUHÝ, J.; ROZMAN, J.: xx; Software pro systém monitorování polohy hlavy. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

DRASTICH, A.; ŠTĚPÁNEK, V.; KOLÁŘ, R.: xx; Modelování procesu zobrazení infrakamerou. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/. (Software)
Detail

HARABIŠ, V.; MÉZL, M.; BARTOŠ, M.; JIŘÍK, R.; KOLÁŘ, R.: xx; RegSeq - Registration of image sequences. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

VÍTEK, M.; KOZUMPLÍK, J.: xx; Software pro detekci komplexů QRS. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

SMITAL, L.; VÍTEK, M.; KOZUMPLÍK, J.: xx; Software pro filtraci signálů EKG a srdečních akčních potenciálů. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

LAMOŠ, M.; NOVOTNÝ, A.; KOLÁŘ, R.: xx; Řešení soustav lineárních rovnic iteračními metodami. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

JANOUŠEK, O.; RONZHINA, M.; KOLÁŘOVÁ, J.; PROVAZNÍK, I.: xx; Software pro výpočet parametrů HRV v časové oblasti. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

KOLÁŘ, R.; PLACZEK, R.: xx; Audiometr. xx. URL: http://www.dbme.feec.vutbr.cz. (Software)
Detail

SMITAL, L.; KOZUMPLÍK, J.: xx; Software pro generování myopotenciálů. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

DRASTICH, A.; ZUBAL, L.; KOLÁŘ, R.: xx; Akviziční kontrast při projekčním a projekčně-rekonstrukčním zobrazení. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/. (Software)
Detail

ŠKUTKOVÁ, H.; MADĚRÁNKOVÁ, D.; PROVAZNÍK, I.: xx; Analyzátor pro tvorbu a vyhodnocení fylogenetické stromové struktury. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

HRUBEŠ, J.; KOZUMPLÍK, J.: xx; Software pro kompresi signálů EKG. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

ODSTRČILÍK, J.; JAN, J.; KOLÁŘ, R.; GAZÁREK, J.: xx; Software pro segmentaci cévního řečiště na snímcích sítnice. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

LAMOŠ, M.; DRASTICH, A.; KOLÁŘ, R.: xx; Modelování metod číslicového zpracování obrazu u digitální radiografie. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

WALEK, P.; WALCZYSKO, M.; KOLÁŘ, R.: xx; Numerické řešení algebraické rovnice. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

LAMOŠ, M.; NOVOTNÝ, A.; KOLÁŘ, R.: xx; Výpočet směru srdeční osy. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

MADĚRÁNKOVÁ, D.; ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.: xx; Similarity Analysis Based On Nucleotide Density Software. xx. URL: http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty. (Software)
Detail

KUBEČKA, L.; JAN, J.; KOLÁŘ, R. Retrospective Illumination Correction of Retinal Images. International Journal of Biomedical Imaging, 2010, vol. 2010, no. 5, p. 201-223. ISSN: 1687-4188.
Detail

ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Similarity analysis of primary and secondary structures of metallothioneins. In The 10th IEEE International Conference on Information Technology and Applications in Biomedicine: Emerging Technologies for Patient Specific Healthcare. Corfu: IEEE, 2010. p. 1-4. ISBN: 978-1-4244-6560-6.
Detail

JANOUŠEK, O.; KOLÁŘOVÁ, J.; NOVÁKOVÁ, M.; PROVAZNÍK, I. Three-Dimensional Electrogram in Spherical Coordinates: Application to Ischemia Analysis. PHYSIOLOGICAL RESEARCH, 2010, vol. 59, no. Suppl 1, p. S51 (S58 p.)ISSN: 0862-8408.
Detail

RONZHINA, M.; JANOUŠEK, O.; SCHEER, P.; NOVÁKOVÁ, M.; PROVAZNÍK, I.; KOLÁŘOVÁ, J. Determination of the Frequency Bands for Heart Rate Variability: Studies on the Intact and Isolated Rabbit Hearts. In Computers in Cardiology. Belfast, UK: IEEE, 2010. p. 1-4. ISBN: 978-80-214-4106-4.
Detail

VÍTEK, M.; HRUBEŠ, J.; KOZUMPLÍK, J. A Wavelet-Based ECG Delineation With Improved P Wave Offset Detection Accuracy. In Proceedings of Biosignal 2010: Analysis of Biomedical Signals and Images. Brno: UBMI FEKT VUT v Brně, 2010. p. 1-5. ISBN: 978-80-214-4106-4.
Detail

HRUBEŠ, J.; VÍTEK, M.; KOZUMPLÍK, J. Multipoint Validation of Decompressed ECG Signal. In Proceedings of Biosignal 2010: Analysis of Biomedical Signals and Images. Brno: UBMI FEKT VUT v Brně, 2010. p. 1-5. ISBN: 978-80-214-4106-4.
Detail

JANOUŠEK, O.; RONZHINA, M.; KOLÁŘOVÁ, J.; NOVÁKOVÁ, M.; FIALOVÁ, K.; PROVAZNÍK, I. Heart rate variability parameters in isolated rabbit hearts. In Proceedings of Biosignal 2010: Analysis of Biomedical Signals and Images. Brno, Czech Republic: Brno University of Technology, 2010. p. 182-188. ISBN: 978-80-214-4106-4.
Detail

JANOUŠEK, O.; RONZHINA, M.; NOVÁKOVÁ, M.; PROVAZNÍK, I.; KOLÁŘOVÁ, J. Poincaré Plot in Ischemic Rabbit Hearts. In Computers in Cardiology. Belfast, UK: IEEE, 2010. p. 919-922. ISBN: 978-80-214-4106-4.
Detail

JANOUŠEK, O.; RONZHINA, M.; NOVÁKOVÁ, M.; PROVAZNÍK, I.; KOLÁŘOVÁ, J.; SCHEER, P. HRV in isolated rabbit hearts and in vivo rabbit hearts. In Computers in Cardiology. Belfast, UK: IEEE, 2010. p. 923-926. ISBN: 978-80-214-4106-4.
Detail

ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Relationships Of Bacterial Metallothioneins Analyses: Phylogenetic Tree Construction Method. In Analysis of Biomedical Signals and Images. Analysis of Biomedical Signals and Images. Brno: VUT v Brně, 2010. p. 1-6. ISBN: 978-80-214-4106-4. ISSN: 1211-412X.
Detail

MÉZL, M.; JIŘÍK, R.; HARABIŠ, V.; KOLÁŘ, R. Quantitative Ultrasound Perfusion Analysis In Vitro. In Proceedings of Biosignal 2010: Analysis of Biomedical Signals and Images. Analysis of Biomedical Signals and Images. Brno University of Technology, 2010. p. 279-283. ISBN: 978-80-214-4106-4. ISSN: 1211-412X.
Detail

KOLÁŘ, R.; TAŠEVSKÝ, P. Registration of 3D Retinal Optical Coherence Tomography Data and 2D Fundus Images. In Biomedical Image registration. Lecture Notes in Computer Science. 2010. no. 6204, p. 72-82. ISSN: 0302-9743.
Detail

ODSTRČILÍK, J.; KOLÁŘ, R.; HARABIŠ, V.; GAZÁREK, J.; JAN, J. Retinal Nerve Fiber Layer Analysis via Markov Random Fields Texture Modelling. In 18th European Signal Processing Conference (EUSIPCO-2010). 18th European Signal Processing Conference (EUSIPCO-2010). EURASIP. EURASIP, 2010. p. 1650-1654. ISSN: 2076-1465.
Detail

SMITAL, L.; KOZUMPLÍK, J. ECG Signal Denoising Using Wavelet Wiener Filtering. In Proceedings of Biosignal 2010: Analysis of Biomedical Signals and Images. Brno: UBMI FEKT VUT v Brně, 2010. p. 364-368. ISBN: 978-80-214-4106-4.
Detail

HRUBEŠ, J.; VÍTEK, M.; KOZUMPLÍK, J. Vliv komprese signálů EKG na diagnózu. Elektrorevue - Internetový časopis (http://www.elektrorevue.cz), 2010, roč. 2010, č. 55, s. 36-1 (36-4 s.)ISSN: 1213-1539.
Detail

HAVLÍČEK, M.; JAN, J.; BRÁZDIL, M.; CALHOUN, V. Dynamic Granger causality based on Kalman filter for evaluation of functional network connectivity in fMRI data. NEUROIMAGE, 2010, vol. 53, no. 1, p. 65-77. ISSN: 1053-8119.
Detail

SOCHOR, J.; ZÍTKA, O.; ŠKUTKOVÁ, H.; PAVLÍK, D.; BABULA, P.; KRŠKA, B.; HORNA, A.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Content of phenolic compounds and antioxidant capacity in fruits of selected genotypes of apricot with resistance against Plum pox virus. MOLECULES, 2010, vol. 2010, no. 15, p. 6285-6305. ISSN: 1420-3049.
Detail

KOLÁŘ, R.; HARABIŠ, V.; ODSTRČILÍK, J. Hybrid retinal image registration using phase correlation. IMAGING SCIENCE JOURNAL, 2013, vol. 61, no. 4, p. 269-384. ISSN: 1368-2199.
Detail

ODSTRČILÍK, J.; KOLÁŘ, R.; JAN, J.; GAZÁREK, J. Retinal nerve fiber layer texture analysis via markov random fields. Abstracts of Contributions to 6th International Workshop on Data-Algorithms-Decision Making. UTIA. Praha, ČR: UTIA AV ČR, 2010. p. 49-49.
Detail

NOVOTNÝ, A.; ODSTRČILÍK, J.; KOLÁŘ, R.; JAN, J. Texture Analysis Of Nerve Fibre Layer In Retinal Images Via Local Binary Patterns And Gaussian Markov Random Fields. In 20th Biennial International EURASIP Conference BIOSIGNAL 2010. Analysis of Biomedical Signals and Images. EURASIP. Brno: EURASIP, 2010. no. 1, p. 308-315. ISBN: 978-80-214-4106-4. ISSN: 1211-412X.
Detail

HARABIŠ, V.; KOLÁŘ, R.; JIŘÍK, R.; MÉZL, M. Perfusion Curves Modelling For Evaluating Of Ultrasound Image Registration. In Proceedings of Biosignal 2010: Analysis of Biomedical Signals and Images. Analysis of Biomedical Signals and Images. Brno University of Technology, 2010. p. 333-340. ISBN: 978-80-214-4106-4. ISSN: 1211-412X.
Detail

GAZÁREK, J.; JAN, J.; KOLÁŘ, R.; ODSTRČILÍK, J. Bimodal Comparison of Retinal Nerve Fibre Layer Thickness: Fundus Camera versus Optical Coherence Tomography. Abstracts of Contributions to 6th International Workshop on Data-Algorithms-Decision Making. UTIA. Praha, ČR: UTIA AV ČR, 2010. p. 50-50.
Detail

RONZHINA, M.; JANOUŠEK, O.; KOLÁŘOVÁ, J.; NOVÁKOVÁ, M.; FIALOVÁ, K.; PROVAZNÍK, I. Determination of Frequency Bands for Heart Rate Variability in Isolated Rabbit Heart. In Proceedings of Biosignal 2010: Analysis of Biomedical Signals and Images. Brno, Czech Republic: Brno University of Technology, 2010. p. 303-307. ISBN: 978-80-214-4106-4.
Detail