Applied result detail

Analyzátor pro tvorbu a vyhodnocení fylogenetické stromové struktury

ŠKUTKOVÁ, H.; MADĚRÁNKOVÁ, D.; PROVAZNÍK, I.

Original Title

Analyzátor pro tvorbu a vyhodnocení fylogenetické stromové struktury

English Title

Analyzer for reconstruction and evaluation of phylogenetic tree structure

Type

Software

Abstract

Software pro rekonstrukci fylogenetických stromů získaných pomocí různých známých metod s nastavením vstupních parametrů fylogenetické analýzy jako jsou: skórovací matice, výpočet vzájemné distance, rekonstrukční algoritmus, cena mezer apod. U získané stromové struktury dále program umožňuje srovnání metod a analýzu biologických sekvencí pomocí bootstrappingových technik a klastrování s nastavitelnými vstupními kritérii.

Abstract in English

Software for reconstruction and analysis of phylogenetic tree using several different methods with setting of input parameters as: scoring matrixes, distance matrix methods, algorithm for reconstruction, penalties for opening gaps etc.

Keywords

phylogenetic tree, biologic sequences, bootstrapping, tree clusterring, fasta

Key words in English

phylogenetic tree, biologic sequences, bootstrapping, tree clusterring, fasta

Location

Ústav biomedicínského inženýrství, FEKT VUT v Brně, Kolejní 4 61200 Brno

Possibilities of use

only the provider uses the result

Licence fee

Use of the result by another entity is possible without acquiring a license (the result is not licensed)

www

http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty