Master's Thesis

3D bioprinting of stem cells and analysis of microscopic images

Final Thesis 136.45 kB Final Thesis 19.95 MB

Author of thesis: Ing. Mário Kandra

Acad. year: 2016/2017

Supervisor: doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D.

Reviewer: Ing. Ondřej Svoboda

Abstract:

In this diploma thesis we are discussing about using 3D bioprinting in tissue engineering.
We are discribing using biomaterials for construction scaffolder and aplication stem cells
in 3D bioprinting. Last section of theoretical part deals with very often used techniques
of 3D bioprinting and we are focused on extrusion technique. In the practical part we
propose a method for print vasculars structures. We realized prototype of print head,
her design and 3D printing of individual parts. To mechanical part we create a control
system for printing control. At the end we visualize the organization of the cells using
program modules.

Keywords:

3D bioprinting, tissue engineering, scaffolder, extruder, extrusion, stem cells

Date of defence

06.06.2017

Result of the defence

Defended (thesis was successfully defended)

znamkaAznamka

Grading

A

Process of defence

Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Svoboda položil otázku: z jakého důvodu jste zvolil elektronovou mikroskopii? Doc. Drbohlavová položila otázku: jak česky přeložíte scaffold? Bylo by možné použít metodu pro pevné scaffoldy? RNDr. Fuchs položil otázku: Kde mohu v grafu na konci diplomové práce najít směrodatnou odchylku? Jak jste zjistil směrnici přímky, kterou jste prokládal naměřenými body? Student obhájil diplomovou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.

Language of thesis

Czech

Faculty

Department

Study programme

Biomedical Engineering and Bioinformatics (BTBIO-F)

Field of study

Biomedical Engineering and Bioinformatics (F-BTB)

Composition of Committee

prof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (předseda)
doc. Ing. Jana Drbohlavová, Ph.D. (místopředseda)
RNDr. Petr Fuchs, Ph.D. (člen)
Ing. Jan Červený, Ph.D. (člen)
Ing. Martin Vítek, Ph.D. (člen)
Ing. Ondřej Svoboda (člen)

Supervisor’s report
doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D.

Student Mario Kandra si během řešení práce počínal velmi aktivně se zájmem o řešenou problematiku (práce s literaturou, využívání konzultací, atd.). Oceňuji zejména pracovní nasazení a manuální zručnost v jarním semestru. Jeho přístup byl pečlivý a spolehlivý. I když bych uvítal větší samostatnost při designování některých částí projektu, tato slabina byla posléze vyvážena při vyhodnocování experimentálních výsledků a zvláště při samostatném sepisování práce, čímž student prokázal zvládnutí zadané problematiky včetně splnění zadání.
Práci doporučuji k obhajobě a navrhuji známku A – výborně. Points proposed by supervisor: 95

Grade proposed by supervisor: A

Reviewer’s report
Ing. Ondřej Svoboda

Student Mário Kandra se ve své práci zabývá využitím 3D tisku v buněčné biologii, což je téma nanejvýš aktuální. Po formální stránce je práce rozdělena logicky. Čitelnost práce snižují častější překlepy. Teoretická část je napsána přehledně a poskytuje čtenáři dostatečný přehled pro orientaci v praktické části práce. Rovněž rozsah literárních zdrojů je pro diplomovou práci postačující. Praktická část, ve které je kombinována hardwarová a softwarová část, je rovněž kvalitně sepsána. Student dostatečně popisuje jednotlivé kroky a diskutuje optimalizaci výrobního procesu i případné zlepšení a problémy. Ocenil bych pouze lépe identifikované části, které student realizoval sám a na kterých spolupracoval s kolegy, jelikož je téma vysoce multioborové, nelze se takové spolupráci vyhnout. Celkově považuji zadání práce za splněné a hodnotím stupněm A/90b. Topics for thesis defence:
  1. V rámci hodnocení snímků ještě zpracovával fixované vzorky. Z jakého důvodu jste volili elektronovou mikroskopii?
  2. Bylo by možné využít pro studium prostorové distribuce i nějakou z technik „live-cell imaging“?
Points proposed by reviewer: 90

Grade proposed by reviewer: A

Responsibility: Mgr. et Mgr. Hana Odstrčilová