Bakalářská práce Terezie Vašutové se zabývá analýzou a vyhodnocením segmentace kochley z CT snímků se zaměřením na stanovení anatomických parametrů a podporu výběru elektrody pro kochleární implantaci. Práce je logicky členěna do jednotlivých kapitol, které postupně představují teoretická východiska, problematiku segmentace, použité metody měření, zpracovávaný dataset, metodiku, výsledky, diskuzi a závěr. Rozsah práce činí přibližně 54 stran vlastního textu, což lze hodnotit jako nadprůměrné zpracování bakalářské práce. Teoretická část poskytuje podrobný přehled anatomie a fyziologie vnitřního ucha, segmentačních metod a klinického využití získaných parametrů. Místy však působí spíše jako učebnicový přehled a některé pasáže by mohly být více zaměřeny na kritické zhodnocení současného stavu poznání a přímou vazbu na řešenou problematiku. V praktické části studentka popisuje zpracování reálných klinických dat, metodiku segmentace a následné vyhodnocení anatomických parametrů. Kladně hodnotím vlastní implementaci algoritmů v prostředí Python, výpočet parametrů kochley včetně délky kochleárního duktu (CDL), simulaci zavedení elektrod a návrh algoritmu pro predikci vhodného typu elektrody. Metodika je popsána srozumitelně a výsledky jsou vhodně prezentovány pomocí tabulek, grafů a statistických testů. Za drobný nedostatek považuji absenci souhrnného schématu workflow zpracování dat, které by přispělo k lepší orientaci čtenáře v jednotlivých krocích analýzy. Z formálního a jazykového hlediska je práce na velmi dobré úrovni. Text je zpracován dobře v systému LaTeX a obsahuje kvalitně zpracované obrázky a tabulky. Práce využívá přibližně 57 odborných zdrojů, přičemž převážná část citované literatury pochází z posledních let. Studentka čerpá z relevantních medicínských, radiologických i technických publikací.  Za největší přínos práce považuji její praktickou využitelnost. Analýza byla provedena na reálných klinických datech 28 pediatrických pacientů, přičemž bylo prokázáno dosažení vysoké shody automatické segmentace s manuálním zpracováním. Navržený algoritmus pro výběr elektrody dosáhl téměř 70% shody s doporučeními systému OTOPLAN a výsledky mají potenciál pro praktické využití při plánování kochleárních implantací. Studentka zároveň korektně diskutuje omezení práce, zejména velikost datasetu, kvalitu vstupních CT dat a vliv manuálních zásahů při zpracování. Pozitivně hodnotím také její zájem o problematiku a strávený čas v ambulanci při nastavování kochleárních implantátů, což prohloubilo její znalosti souvislostí v praxi. Studentka při řešení prokázala schopnost samostatné odborné práce, osvojila si pokročilé metody zpracování obrazových dat a vytvořila několik vlastních algoritmů s potenciálním klinickým využitím. Zadání práce považuji za splněné ve všech bodech. Práci hodnotím jako nadprůměrnou bakalářskou práci s výrazným vlastním přínosem a navrhuji hodnocení 96 bodů, známka A. Points proposed by supervisor: 96

Předložená bakalářská práce se zabývá analýzou přesnosti segmentačních přístupů pro segmentaci kochley z CT dat a následnou analýzou vlivu přesnosti segmentace na přesnost odhadu délky kochleárního kanálu pro účely volby optimální délky elektrody kochleárního implantátu. Na základě literární rešerše jsou v práci zvoleny a otestovány 3 segmentační přístupy, které jsou vyhodnoceny podle několika vhodně zvolených metrik. Dále jsou různé výsledky segmentace využity pro odhad 3 anatomických parametrů kochley a jejich vliv je objektivně vyhodnocen. Dále byly implementovány a porovnány 4 metody odhadu délky kochleárního kanálu, a to na úrovni Cortiho orgánu a na úrovni laterální stěny. Veškeré výsledky byly také detailně statisticky vyhodnoceny a diskutovány včetně limitací, což hodnotím velmi kladně. Po formální, prezentační i odborné stránce je práce na velmi dobré úrovni. Drobné výhrady mám pouze k občasnému neodbornému vyjadřování (např.: anatomické parametry A, B, H jsou nazvány body, ačkoliv jde o přímky). Studentka ve své práci využila velkého množství relevantních literárních zejména zahraničních zdrojů. Odkazy na reference jsou ale v drtivé většině případů umístěny za celými odstavci, a často i více zdrojů najednou, což není standardní a znemožňuje přesně identifikovat, která část textu pochází ze kterého zdroje. I přes uvedené výtky se však jedná o velmi kvalitní bakalářskou práci, kde studentka porovnala velké množství různých výsledků, navrhla vlastní možnosti měření včetně rozsáhlých statistických analýz, a prokázala tak schopnosti řešit reálné klinické problémy. Zadání práce považuji za splněné a celkově hodnotím práci stupněm A (92 bodů). Points proposed by reviewer: 92