Master's Thesis

Multimodal Characterization of Mechanical Properties of Hydrogel Systems Using Dynamic Mechanical Analysis and Atomic Force Microscopy

Final Thesis 2.18 MB

Author of thesis: Bc. Simona Nováková

Acad. year: 2025/2026

Supervisor: Ing. Jiří Smilek, Ph.D.

Reviewer: Ing. Tomáš Plichta, Ph.D.

Abstract:

This master’s thesis focuses on the characterization of the mechanical properties of hydrogel systems at both macroscopic and microscopic levels. The preparation of the gels was optimized for specific measurement methods, which included Dynamic Mechanical Analysis using compression and tensile tests, as well as Atomic Force Microscophy. The mechanical properties were studied from a macroscopic perspective using Dynamic Mechanical Analysis. This method was used to investigate the influence of polymer concentration and swelling time
on the final mechanical properties via compression testing. A 0.1M CaCl2 solution was used
for swelling and the formation of interpenetrating networks; in all other cases, the gels were swollen in water. Furthermore, tensile tests were used to determine Young’s modulus values
for a concentration series of polyethyleneglycol diacrylate hydrogels, as well as hydrogels
with an interpenetrating and semi-interpenetrating polymer networks containing sodium alginate. The mechanical properties of polyethyleneglycol diacrylate hydrogels
with interpenetrating networks formed by adding varying concentrations of sodium alginate were also examined. Characterization of mechanical properties was also performed
at the micro-level using Atomic Force Microscophy. For this purpose, the semicontact mode was selected to prevent damage of the sample surface. Local Young’s modulus values were obtained for the polyethyleneglycol diacrylate hydrogels’ concentration series
and for the interpenetrating networks with sodium alginate. A critical step was the evaluation procedure of the acquired Atomic Force Microscophy data, involving baseline correction
and determination of contact point. The application of the Hertz model based on the probe tip geometry, as well as the value of the Poisson’s ratio, played a key role in the resulting local Young’s modulus values. The results showed an increasing trend in the Young’s modulus relative to the polymer concentration for polyethyleneglycol diacrylate hydrogel series,
as measured by both Dynamic Mechanical Analysis and Atomic Force Microscophy.
The formation of the interpenetrating network led to an enhancement of the mechanical properties, as confirmed by both Dynamic Mechanical Analysis tensile testing and Atomic Force Microscophy.

Keywords:

Mechanical properties, Hydrogel, Dynamic mechanical analysis, Atomic force microscophy, Young’s modulus, Interpenetrating network, Polyethyleneglycol diakrylate, Sodium alginate

Date of defence

26.05.2026

Result of the defence

Defended (thesis was successfully defended)

znamkaBznamka

Grading

B

Process of defence

1. Studentka seznámila členy komise s náplní a cílem diplomové práce. 2. Byly přečteny posudky na diplomovou práci. 3. Studentka akceptovala všechny připomínky oponenta a na všechny otázky odpověděla v plné šíři. Diskuse: prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. Jaké by mohly být aplikace gelů, kterými jste se v práci zabývala? Jsou všechny složky biokompatibilní? doc. Ing. Petr Sedláček, Ph.D. Můžete objasnit graf namáhání? Z jakého bodu vycházíte? Můžete popsat graf namáhání IPN sítí? Je to vratné? Pozorovala jste adhezi u oddalovacích křivek? Jak to bylo u IPN gelů? doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. Pokud by byla aplikace do tkáňového inženýrství, jaké typy buněk by bylo možné použít? Studentka odpověděla na všechny doplňující otázky členů komise, které byly v průběhu diskuse k dané problematice vzneseny. V diskusi studentka prokázala velmi dobrou orientaci v dané problematice. Po diskusi následovalo hodnocení závěrečné práce. Diplomantka prokázala nejen velmi dobré odborné znalosti i schopnost samostatné prezentace dosažených výsledků.

Language of thesis

Czech

Faculty

Department

Study programme

Chemistry for Medical Application (NPCP_CHMA)

Specialization

Chemistry of Bioactive Substances (CHBL)

Composition of Committee

prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (předseda)
doc. Ing. Petr Sedláček, Ph.D. (místopředseda)
doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (člen)
prof. Ing. Adriána Kovalčík, Ph.D. (člen)
doc. Ing. Eva Vítová, Ph.D. (člen)
doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (člen)

Supervisor’s report
Ing. Jiří Smilek, Ph.D.

Diplomová práce Simony Novákové se zabývá multimodální charakterizací mechanických vlastností hydrogelových systémů pomocí dynamické mechanické analýzy a mikroskopie atomárních sil. Práce tematicky navazuje na výzkum realizovaný na pracovišti a je zaměřena na studium mechanických vlastností hydrogelů na makroskopické i mikroskopické úrovni.

Studentka během řešení práce realizovala experimentální část zahrnující přípravu hydrogelových systémů na bázi polyethylenglykol diakrylýtu a alginátu sodného, optimalizaci podmínek měření a následnou charakterizaci pomocí dynamické mechanické analýzy a mikroskopie atomárních sil. Pozitivně hodnotím zejména rozsah provedených experimentů a snahu propojit výsledky získané pomocí DMA a AFM měření. Oceňuji také práci s AFM daty, zejména aplikaci Hertzova modelu a postup při vyhodnocování lokálního Youngova modulu.

Studentka prokázala velmi dobrou orientaci v odborné literatuře a schopnost pracovat s aktuálními literárními zdroji. Literární poznatky byly vhodně využity při návrhu experimentální části práce, i když hlubší kritické porovnání některých výsledků s publikovanými daty mohlo být místy propracovanější.

Výsledky práce jsou prezentovány přehledně pomocí grafů a tabulek a studentka prokázala schopnost samostatné laboratorní práce i základní orientaci při zpracování experimentálních dat. Diskuse výsledků je logická a odpovídá zaměření práce. Byly popsány například změny mechanických vlastností v závislosti na koncentraci PEGDA i vliv tvorby interpenetrujících sítí na výsledné mechanické parametry hydrogelů. Přesto je právě interpretace výsledků slabší částí předložené práce. Diskuse místy zůstává převážně na úrovni popisu pozorovaných trendů bez hlubšího rozboru fyzikálně-chemických souvislostí nebo detailnější konfrontace s literárními daty. Některé závěry mohly být formulovány kritičtěji a s větším důrazem na omezení použitých metod či možné zdroje experimentálních odchylek.

Práce je po formální stránce zpracována na velmi dobré úrovni. V textu se však objevují drobné stylistické a formální nedostatky, místy méně obratné formulace či překlepy, které snižují celkovou úroveň práce. V některých částech práce by bylo rovněž vhodné systematičtější členění výsledků a stručnější formulace některých pasáží.

Studentka během řešení práce pravidelně využívala konzultací a aktivně komunikovala průběh experimentální práce i dosažené výsledky. Přístup studentky k řešení práce hodnotím jako zodpovědný a systematický.

Předložená diplomová práce Simony Novákové přes uvedené připomínky splňuje požadavky kladené na diplomové práce realizované na FCH VUT. Studentka prokázala schopnost realizovat experimentální práci, pracovat s odbornou literaturou a zpracovat získaná experimentální data. Práci doporučuji k obhajobě a navrhuji hodnocení B – velmi dobře.
Evaluation criteria Grade
Splnění požadavků zadání B
Studium literatury a její zpracování A
Využití poznatků z literatury B
Kvalita zpracování výsledků B
Interpretace výsledků, jejich diskuse B
Závěry práce a jejich formulace A
Využívání konzultací při řešení práce A
Celkový přístup k řešení úkolů A

Grade proposed by supervisor: B

Reviewer’s report
Ing. Tomáš Plichta, Ph.D.

Bc. Simona Nováková se ve své diplomové práci zabývala studiem hydrogelových systémů a jejich mechanických vlastností za využití technik dynamické mechanické analýzy a mikroskopie atomárních sil za účelem stanovení zmíněných vlastností v makro- a mikro-, případně až nanoměřítku. Jedná se o aktuální a velice zajímavé téma z pohledu potenciálních aplikací v biomedicíně či tkáňovém inženýrství.

Studentka poskytuje v úvodu a teoretické části dostatečný a většinou logicky uspořádaný základ k porozumění dané problematiky, přičemž čerpala z poměrně velkého množství aktuálních impaktovaných publikací. V kapitole zaměřené na výsledky je pak možné najít rozsáhlé množství výsledků, kdy připravila hydrogelové systémy a jejich semi-IPN a IPN obdoby na bázi polyethylenglykol diakrylátu o různých koncentracích. Ty byly následně vystaveny také botnání a dále testovány příslušnými metodami. Z analýz se většina výsledků zabývá DMA tlakovými a tahovými testy a AFM. Pomocí zmíněných metod pak byla studentka schopna komplexně popsat a charakterizovat připravené hydrogely. Diskuze výsledků však prakticky postrádá širší srovnání s výsledky jiných autorů.

Z formálního hlediska tato práce obsahuje poměrně velké množství nepřesných formulací, které snižují úroveň a celkový dojem. Nemalé množství vět je velice krkolomně formulováno, což je pravděpodobně způsobeno ne úplně vhodným překladem. Je zde možné hojně najít typografické chyby, gramatické chyby a překlepy či chybně přeložené termíny. Namátkou lze zmínit výrazy methakralát, kyselina gluronová a gulunová, měkká hmota, hydrogely propojené krystalizací, implantace in vitro, homeostatické obvazy, konstanta pružiny či laserový paprsek. Nesrozumitelné či chybné formulace jako například: využívá průběhu chemické reakce jako vysokoenergetického záření; do okamžiku rovnováhy, kdy volná voda přestane reagovat s vázanou vodou systému; roztok polymeru je vystaven UV a následně dochází ke vzniku iniciátorů; díky generování křivek síla-vzdálenost lze manipulovat s vlastnostmi jako je tuhost materiálu; hydrogely byly využívány jako metody, vychýlení a posuv konzole jsou převedeny na křivky závislosti síly na vzdálenosti; AFM hrot kontroluje topografii vzorku; hydrogely mohou při zvýšení teploty odpařit vodu, a tím dochází k úniku iontů; další možností popisující fyzikální typ síťování je úprava intramolekulárních sil, atd. Také není pravdou, že i přes značný vývoj vysokorychlostního skenování na AFM, je rychlost skenování a získání výsledků nedostatečná pro zachycení velice rychlých biologických změn.
V experimentální části jsou zapojení přístrojů a postupy měření popsány do nebývalých detailů, avšak bych více ocenil například popsání obecné tahové křivky a termíny z mechaniky ji popisující, které jsou následně v textu používány. Nemyslím si například, že termín „namáhání“ místo „deformace“ je správný a ani, že se IPN gely jevily tvrdě. Doporučil bych se v rámci práce pro lepší pochopení držet zavedené terminologie, nekombinovat termíny náhodně například raménko/nosník/konzola, navíc občas zaměňovat za hrot a naopak. Obdobně v rámci věty o DMA píšete „poskytuje informaci o elastickém modulu, paměťovém modulu a tlumící faktor ztrát tan δ získaný poměrem ztrátového a paměťového modulu.“ Často je to pro čtenáře matoucí, a to částečně i napříč mezi jednotlivými metodami a kapitolami. Při popisu Obr. 20 a 23 mluvíte o těchto dvou zmíněných modulech, v grafu však jeden z nich chybí. Obr. 9 a 12 by mohly být umístěny vhodněji, u druhého navíc chybí odkaz.

Graficky bych doporučil tahové křivky vykreslovat jako čárové grafy, nikoli bodově s vyznačenými křížky. Do budoucna by bylo určitě žádoucí se více zaměřit na teorii mechaniky a zkusit využít i jiné modely kontaktní mechaniky pro stanovení modulu pružnosti ze získaných křivek z AFM. U tahové zkoušky je uvedeno, že pro všechny vzorky proběhlo měření různým způsobem kvůli odlišnému charakteru. Dynamika testování má velký vliv na stanovené výsledky. I přesto, že tahová zkouška je pro charakterizaci hydrogelů běžně využívána, tak u těchto systémů, navíc nabotnalých, může během deformace docházet k vytlačování vody, což ovlivňuje mechanickou odezvu materiálu. To vše bude způsobovat velké potíže při správné interpretaci a porovnávání.

Závěrem bych chtěl konstatovat, že navzdory těmto nedostatkům, obsahuje tato práce velké množství výsledků, které jsou velice cenné pro navazující práci a určitě přinesou v budoucnu po vhodnějším zpracování kvalitní publikace. Domnívám se, že potenciál tohoto progresivního tématu, jako je studium hydrogelů a jejich mechanických vlastností, je velmi dobrý a doporučuji v něm pokračovat.

S ohledem na výše uvedené komentáře doporučuji k obhajobě a hodnotím stupněm C.
Evaluation criteria Grade
Splnění požadavků zadání A
Logické členění práce B
Kvalita zpracování výsledků C
Interpretace výsledků, jejich diskuse C
Využití literatury a její citace B
Úroveň jazykového zpracování C
Formální úroveň práce – celkový dojem C
Závěry práce a jejich formulace C
Topics for thesis defence:
  1. Jak byla dosažena výška vzorku 800 µm u DMA, bylo toho docíleno během přípravy nebo byl vzorek vyšší a byl stlačen přibližujícími se geometriemi? V grafech pro tlakové zkoušky je uvedeno namáhání (předpokládám, že se jedná o deformaci) s jednotkami [%], ale u tahových zkoušek je namáhání uvedeno jak v %, tak bez jednotek. Proč?
  2. Píšete, že QI mód je zobrazovací a dále, že výsledné hodnoty pro AFM měření mohly být ovlivněny celkovou distribucí pórů i lokální hustotou polymerního řetězce. To by právě snímek ukázal. Jelikož je AFM primárně zobrazovací metoda k tomu vyvinuta můžete nějaké topografické snímky ukázat ideálně v kombinaci s mapou mechanických vlastností? Proč nepoužíváte místo QI tedy jen spektroskopický mód, který je pro získání silové křivky vhodnější a není tolik zatížen chybou posunu hrotu při skenování?
  3. Píšete, že Hertzův model je vhodný pro lineárně elastické materiály, což měkké a viskoelastické hydrogely často nejsou, že výsledky mohou být nad/podhodnocené a je třeba zvážit vhodnost. Navíc, pokud tyto materiály nemají nízkou adhezi, tak jeho aplikovatelnost také nemůže platit. Proč tento model tedy používáte, co očekáváte od srovnání manuálního a softwarového vyhodnocení, neměly by se hodnoty shodovat? Dále uvádíte, že u semi-IPN vzorků nemohlo být měření pomocí AFM provedeno, jelikož vzorek nešlo uchytit. Jaký je důvod? Souvisí to s vlastnostmi neshodujícími se s aplikací Hertzova modelu?
  4. Pouze v závěru píšete, že „Bylo zjištěno, že nejvíce ovlivnila výsledné hodnoty E indentační hloubka, kontaktní bod a hodnota Setpoint. Důležité bylo zjištění, že námi zvolený hrot, který disponuje kuličkovým tvarem, rozkládal působící sílu na větší plochu než v případě ostrého hrotu, což vedlo k nízkému kontaktnímu tlaku a nízké hodnotě Youngova modulu. Nízká hodnota konstanty pružnosti signalizovala měkký hrot, který klouzal po povrchu vzorku a nedošlo tak k dostatečné indentaci materiálu.“ Nikde jsem však žádná data k tomuto tvrzení nenašel. Nejsem si jist, ale tvrdíte, že hrot je měkký či dokonce v jiné časti textu příliš měkký vzhledem k tuhosti vzorku, a navíc klouže po povrchu. Můžete to nějak komentovat?

Grade proposed by reviewer: C

Responsibility: Mgr. et Mgr. Hana Odstrčilová