Diplomová práce Bc. Adély Šebestové se věnuje detekci toxigenních plísní a hodnocení výskytu vybraných mykotoxinů v čerstvém i lyofilizovaném ovoci a zázvoru. Jedná se o téma vysoce aktuální z hlediska bezpečnosti potravin a ochrany veřejného zdraví, které reflektuje současné trendy v monitoringu kontaminantů v potravinovém řetězci i rostoucí oblibu moderních typů potravin. Cíle práce studentka splnila.

Teoretická část je zpracována na velmi dobré úrovni. Studentka prokázala výbornou orientaci v odborné literatuře, kterou dokázala systematicky utřídit a kriticky vyhodnotit. Rešerše komplexně pokrývá problematiku toxigenních plísní, mykotoxinů, faktorů ovlivňujících jejich výskyt, moderních analytických metod i legislativních požadavků. Teoretické poznatky byly vhodně využity při návrhu experimentální části. Experimentální část je poměrně rozsáhlá a zahrnuje široké spektrum analytických přístupů – od klasických kultivačních metod a mikroskopie přes molekulárně‑biologické techniky (qPCR) až po imunoanalytické stanovení mykotoxinů metodou ELISA. Velmi pozitivně hodnotím zejména optimalizaci izolace DNA, kde studentka porovnala několik postupů. Studentka prokázala vysokou míru samostatnosti, pečlivosti a metodické práce.

Výsledky jsou prezentovány přehledně, s využitím tabulek a obrazové dokumentace. Interpretace je logická, věcná a podložená literárními zdroji i experimentálními daty. Studentka diskutuje rozdíly mezi jednotlivými typy vzorků (čerstvé, laboratorně lyofilizované a komerčně lyofilizované produkty) a věnuje pozornost i limitacím použitých metod, například interferencím při ELISA analýzách. Prokazuje schopnost kritického myšlení a zasazení výsledků do širšího kontextu bezpečnosti potravin.

Závěry práce jsou formulovány jasně, přehledně a odpovídají výsledkům. Mají také praktický význam, zejména ve vztahu k hodnocení bezpečnosti komerčních lyofilizovaných produktů.

Studentka pracovala po celou dobu řešení práce samostatně, systematicky a s vysokou mírou odpovědnosti. Velmi pozitivně hodnotím její aktivní přístup, kdy samostatně vyhledávala a navrhovala experimentální postupy, které následně úspěšně zavedla a aplikovala (např. mikroskopické vyšetření, kultivační analýzy s detekcí mykotoxinů v kultivačním médiu). Aktivně využívala konzultace a projevovala hluboký zájem o řešenou problematiku.

Formální stránka práce je na dobré úrovni. Text je stylisticky kultivovaný, přehledně strukturovaný a obsahuje pouze drobné nedostatky, které nenarušují celkovou kvalitu. Na základě provedené kontroly plagiátu byla zjištěna míra podobnosti 6,3 %, což odpovídá plně originálnímu textu. 

Práce splňuje všechny požadavky kladené na diplomovou práci, proto ji doporučuji k obhajobě a hodnotím ji klasifikačním stupněm „výborně“ – A.

Diplomová práce se zabývá detekcí toxigenních plísní a analýzou vybraných mykotoxinů (aflatoxinů a ochratoxinu A) v čerstvém a lyofilizovaném ovoci a zázvoru. Autorka splnila všechny body zadání – zpracovala rozsáhlou literární rešerši, navrhla a realizovala PCR protokol, provedla optimalizaci izolace DNA a aplikovala qPCR i ELISA metody. Práce je po obsahové stránce velmi komplexní a odpovídá náročnosti diplomové práce.
  Práce vykazuje velmi dobrou odbornou úroveň. Autorka prokazuje znalost moderních analytických metod a jejich limitací. Experimenty jsou provedeny pečlivě, výsledky jsou prezentovány přehledně a doplněny adekvátní diskuzí. Oceňuji zejména porovnání různých izolačních kitů a kritické zhodnocení primerů pro qPCR.
Práce má praktický přínos v oblasti bezpečnosti potravin, zejména:
●    porovnání kontaminace čerstvých a lyofilizovaných produktů,
●    ověření vhodnosti dostupných PCR primerů,
●    potvrzení bezpečnosti komerčních lyofilizovaných produktů,
●    optimalizace izolace DNA z problematických matric.
Výsledky mohou být využitelné v laboratorní praxi i při kontrole kvality potravin.

Diplomová práce splňuje všechny požadavky kladené na závěrečnou práci magisterského studia. Autorka prokázala velmi dobrou orientaci v problematice, schopnost samostatné laboratorní práce i kritického vyhodnocení výsledků. Práci doporučuji k obhajobě. Navrhovaná známka: A Topics for thesis defence:

1. 1/ Jaké jsou hlavní limity metody ELISA při analýze lyofilizovaného ovoce?
2. 2/ Jaké jsou výhody a nevýhody qPCR oproti klasickým kultivačním metodám v rutinní praxi?
3. 3/ Jak byla zajištěna eliminace případných inhibitorů PCR?