Applied result detail

ProtControl - Software pro stereochemické ověření prostorového uspořádání proteinů

ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.

Original Title

ProtControl - Software pro stereochemické ověření prostorového uspořádání proteinů

English Title

ProtControl - Software pro stereochemické ověření prostorového uspořádání proteinů

Type

Software

Abstract

Software pro stereochemické ověření prostorového uspořádání proteinů na základe Ramachandran a Chi diagramů. Software podporuje formát pdb pro zápis molekulové struktury proteinu. Stanoví torzní úhly mezi atomy a ověří stereochemickou kvalitu prostorového záznamu molekuly získaného pomocí NMR nebo krystalografií. Dále vykreslí rozložení páteřní struktury molekuly proteinu a postranní řetězce jednotlivých aminokyselin.

Abstract in English

Software verification of stereochemical quality of proteins structures based on Ramachandran and Chi plots. Software pro stereochemické ověření prostorového uspořádání proteinů na základe Ramachandran a Chi diagramů. Software podporuje formát pdb pro zápis molekulové struktury proteinu. Stanoví torzní úhly mezi atomy a ověří stereochemickou kvalitu prostorového záznamu molekuly získaného pomocí NMR nebo krystalografií. Dále vykreslí rozložení páteřní struktury molekuly proteinu a postranní řetězce jednotlivých aminokyselin.

Keywords

Ramachandran plot, Chi plot, stereochemistry, torsion angle, protein secondary structure, pdb

Key words in English

Ramachandran plot, Chi plot, stereochemistry, torsion angle, protein secondary structure, pdb

Location

Ústav biomedicínského inženýrství, FEKT VUT v Brně, Kolejní 4 61200 Brno

Possibilities of use

only the provider uses the result

Licence fee

Use of the result by another entity is possible without acquiring a license (the result is not licensed)

www