Applied result detail

Software pro zpracování elektroforetogramu z 1D gelové elektroforézy

ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I.

Original Title

Software pro zpracování elektroforetogramu z 1D gelové elektroforézy

English Title

Software for processing of electrophoretogram of 1D gel electrophoresis

Type

Software

Abstract

Software pro vyhodnocení příbuznosti mikroorganismů a biologických makromolekul po separaci na 1D gelové elektroforéze. Software provede filtraci obrazového záznamu elektroforetogramu, převede elektroforetogram na 1D signály popisující jednotlivé mikroorganismy a kombinací metod dynamického borcení časové osy a shlukové analýzy vyhodnotí příbuznost mikroorganismů formou dendrogramu.

Abstract in English

Software for evaluating similarity of microorganisms and biological macromolecules after separation on 1D gel electrophoresis. The software performs image filtering of electrophoretogram, converts electrophoretogram on 1D signals describing microorganisms. The combination of dynamic time warping and cluster analysis evaluates relationship of microorganisms by dendrogram.

Keywords

electrophoretogram, cluster analysis, dynamic time warping

Key words in English

electrophoretogram, cluster analysis, dynamic time warping

Location

Ústav biomedicínského inženýrství, FEKT VUT v Brně, Kolejní 4 61200 Brno

Possibilities of use

only the provider uses the result

Licence fee

Use of the result by another entity is possible without acquiring a license (the result is not licensed)

www

http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty