Řídící software pro systém na izolaci a amplifikaci nukleových kyselin

Software for a system based on the nucleic acid isolation and amplification.

Software

Účelem registrovaného vestavěného firmwaru v mikročipovém ovladači je cyklovat a řídit teplotu pro amplifikaci nukleových kyselin, řídit polohu magnetu pro čištění nukleových kyselin a řídit fluorescenční detekční systém. Teplota je řízena ohřevem/chlazením termoelektrického chladiče (TEC) pomocí systému pulzně šířkové modulace s metodou proporcionální integrační derivace s uzavřenou zpětnovazební smyčkou. Firmware řídí také ventilátor, aby udržoval konstantní teplotu spodní desky TEC a zabránil jejímu přehřátí a. zničení nadměrným teplem. Mikročip komunikuje s externím systémem pomocí USB rozhraní. Firmware je také zodpovědný za řízení výkonu LED používané pro měření fluorescence a zpracování dat z digitálního lock-in zesilovače zabudovaného v systému

Purpose of registered embedded firmware in a microchip controller is to cycle and control temperature for nucleic acid amplification, control location of the magnet to perform nucleic acid purification and to control the fluorescence detection system. The temperature is controlled by heating/cooling of the thermoelectric cooler (TEC) using pulse width modulation system with proportional integrative derivative closed feedback loop method. The firmware controls also the fan to keep the lower plate TEC temperature constant and avoid its overheating and thermal runaway. The microchip communicates with external system using USB interface. The firmware is also responsible to control power of the LED used for fluorescence measurement and the data processing from the digital lock-in amplifier also embedded in the system.

PCR protocol control, fluorescence measurement, magnet location control, nucleic acid amplification, nucleic acid purification

PCR protocol control, fluorescence measurement, magnet location control, nucleic acid amplification, nucleic acid purification

FEKT UMEL

The result is being used by the owner

https://www.umel.fekt.vut.cz/vysledky-vav

Description of the control software