Applied result detail

PhyloGenSig - Software pro konstruci fylogramů z genomických signálů

ŠKUTKOVÁ, H.; SEDLÁŘ, K.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I.

Original Title

PhyloGenSig - Software pro konstruci fylogramů z genomických signálů

English Title

PhyloGenSig - Software for construction phylogram from genomic signals

Type

Software

Abstract

Program umožňuje konvertovat DNA sekvence na genomické signály, provést kompresi pro extrémně dlouhé signály (celogenomové průběhy), zarovnat signály pomocí DTW, vyhodnotit jejich podobnost a sestrojit fylogram.

Abstract in English

The program allows you to convert DNA sequence of the genomic signals, perform compression for extremely long signals (genome sequences), align signals using DTW, evaluate their similarities and construct phylogram.

Keywords

genomic signals, phylogenetics, dynamic time warping

Key words in English

genomic signals, phylogenetics, dynamic time warping

Location

Ústav biomedicínského inženýrství, FEKT VUT v Brně, Technická 12 61600 Brno

Possibilities of use

only the provider uses the result

Licence fee

In order to use the result by another entity, it is always necessary to acquire a license

www

http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty