Přístupnostní navigace
E-přihláška
Vyhledávání Vyhledat Zavřít
diplomová práce
Autor práce: Ing. Lukáš Klouba
Ak. rok: 2016/2017
Vedoucí: Ing. Denisa Maděránková, Ph.D.
Oponent: doc. Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D.
Cílem této práce je vytvořit algoritmus, který pomocí sufixových konstrukcí umožní zarovnání genomu dvou organismů, a implementovat jej do programového prostředí jazyka R. Práce se věnuje popisu konstrukce sufixových struktur a metodami celogenomového zarovnání. Výsledkem práce je funkční algoritmus pro celogenomové zarovnání pomocí sufixových struktur implementovaný v programovém prostředí R a jeho srovnání s podobnými programy pro celogenomové zarovnání.
sufixové stromy, sufixová pole, Ukkonenův algoritmus, R, celogenomové zarovnání
Termín obhajoby
06.06.2017
Výsledek obhajoby
obhájeno (práce byla úspěšně obhájena)
Klasifikace
C
Průběh obhajoby
Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Maděránková položila otázku: Co to jsou treponemy? Doc. Kolář položil otázku: Jak je možné zrychlit navržený algoritmus? Student obhájil bakalářskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.
Jazyk práce
čeština
Fakulta
Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Ústav
Ústav biomedicínského inženýrství
Studijní program
Biomedicínské inženýrství a bioinformatika (BTBIO-F)
Studijní obor
Biomedicínské inženýrství a bioinformatika (F-BTB)
Složení komise
doc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D. (místopředseda) doc. RNDr. Martin Kovár, Ph.D. (člen) Ing. Marina Filipenská, Ph.D. (člen) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen) Ing. Vratislav Čmiel, Ph.D. (člen)
Posudek vedoucíhoIng. Denisa Maděránková, Ph.D.
Známka navržená vedoucím: B
Posudek oponentadoc. Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D.
Známka navržená oponentem: C