Ve spolupráci s Odborem ekonomiky a účetnictví se toto oddělení stará primárně o ekonomický informační systém (EIS) SAP. Má však pod správou i některé další systémy.
Hlavní činnosti oddělení lze rozdělit na následující okruhy:
Správa kmenových a systémových dat (např. tvorba a nastavení účtů hlavní knihy, správa uživatelských přístupů, generování mezd zaměstnanců, ...).
Vývoj systému (jedná se zejména o legislativní, ale také i vnitřní požadavky na programové zázemí a fungování samotného EIS).
Podpora uživatelů (zahrnuje jak klasickou odbornou podporu, tak periodická školení, jejichž cílem je neustálé seznamování uživatelů s fungováním systému).
Koordinace a rozvoj EET pokladen Mercator (mimo jiné i zakládání prodávaných služeb, správa uživatelů a kmenových dat atp.).
Podpora uživatelů a správa služby eSpis (např. přidělování oprávnění, kontrola správné funkce systému, komunikace s dodavatelem).